随机模式匹配并行算法在工作站机群上的实现.pdfVIP

Computer Engineering and Applications 计算机工程与应用 2010 ，46 （21 ） 129 随机模式匹配并行算法在工作站机群上的实现 薛淞文，申卫昌，剡公孝，乔 龙 XUE Song-wen ，SHEN Wei-chang ，YAN Gong-xiao ，QIAO Long 西北大学 信息科学与技术学院，西安 710127 School of Information Science and Technology ，Northwest University ，Xi ’an 710127 ，China E-mail ：xue_song_wen@ 163.com XUE Song-wen ，SHEN Wei-chang ，YAN Gong-xiao ，et al.Implementation of parallel algorithms for randomized pattern matching on cluster of workstations.Computer Engineering and Applications ，2010 ，46 （21 ）：129-131. Abstract ：A newly improved pattern matching algorithm is designed by analyzing randomized algorithm for pattern match- ing and an effective parallel algorithm for pattern matching based on MPICH is designed according to the features of task communication on MPICH parallel programming environment.Text string is divided into overlapped sub-string according to the quantity of process in COW （Cluster of Workstations ），and each process executes pattern matching parallelly.The experi- mental results show that the pattern matching speed is accelerated and the utilization of resources in COW is also improved. Key words ：pattern matching ；an implementation of the Message Passing Interface （MPICH ）；parallel algorithm ；cluster of workstations 摘 要：对随机模式匹配算法进行了改进，并根据MPICH 并行编程环境中任务间通信的特点，设计了一种基于MPICH 的改进的 随机模式匹配并行算法。根据运行在COW （工作站机群）上的进程数目将文本串进行重叠划分，每个进程完成一个文本子串的 模式匹配。实验结果表明，该改进的随机模式匹配并行算法有效地加快了模式匹配的速度，提高了工作站机群的资源利用率。 关键词：模式匹配；消息传递编程标准的一种实现（MPICH ）；并行算法；工作站机群 DOI ：10.3778/j.issn. 1002-8331.2010.21.036 文章编号：1002-8331（2010 ）21-0129-03 文献标识码：Ａ 中图分类号：TP311.1 模式匹配是计算机科学中研究得最广泛的问题之一，它在 度为m 的n-m+ 1个子串分别与模式串X 逐个字符进行比较，而 入侵检测、图像处理、文献检索、信息检索以及分子生物学等领 随机模式匹配算法主要采用了散列（Hash ）技术的思想，它能 域有着广泛的应用。在许多实际应用中，正文串的规模很大，利 [1] 提供对数级的时间复杂度 。其基本思想