仿生自组织计算阵列体系结构关键技术研究-research on key technologies of bionic self-organizing computing array architecture.docxVIP

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仿生自组织计算阵列体系结构关键技术研究-research on key technologies of bionic self-organizing computing array architecture

Research on Key Technologies of Bio-Inspired Self-Organized Computing Array Architecture Candidate:Lv Qi Supervisor:Prof. Dou Yong A thesis Submitted in partial fulfillment of the requirements for the degree of Master of Engineering in Computer Science and Technology Graduate School of National University of Defense Technology Changsha,Hunan,P. R. China November,2011 国防科学技术大学研究生院工学硕士学位论文 国防科学技术大学研究生院工学硕士学位论文 国防科学技术大学研究生院工学硕士学位论文 国防科学技术大学研究生院工学硕士学位论文 目 录 摘 要 i ABSTRACT ii 第一章 绪论 1 1.1 课题研究背景 1 1.2 仿生容错结构的相关研究 4 1.3 课题研究内容 10 1.4 论文结构 11 第二章 基于标识的仿生自组织计算阵列体系结构 12 2.1 仿生自组织计算阵列的仿生原理 12 2.2 仿生自组织计算阵列的一般结构 13 2.3 仿生自组织计算阵列的容错策略 18 2.4 根据图像匹配算法定制的计算阵列 18 2.4.1 中值滤波算法 19 Sobel 边缘检测算法 26 2.5 本章小结 30 第三章 基于形态发生素模型的计算阵列定序方法 32 3.1 图式形成理论 32 3.2 形态发生素定量描述模型 34 3.2.1 扩散-降解模型 34 3.2.2 被动扩散模型 35 3.2.3 催化剂-抑制剂模型 36 3.3 基于形态发生素模型的计算阵列定序方法 38 3.3.1 多细胞阵列中浓度梯度的建立 39 3.3.2 分布式定序方法 39 3.3.3 分布式定序方法的鲁棒性 41 3.4 本章小结 42 第四章 计算阵列的多功能分化 43 4.1 基于基因激活的多功能分化 43 4.1.1 单个基因的激活 43 4.1.2 多个基因的有序激活 44 第 I 页 第 第 PAGE IV 页 第 第 III 页 4.2 基于侧向激活的多功能分化 47 4.3 本章小结 50 第五章 计算阵列形态发生素模型的模拟电路实现 51 5.1 模拟电路相关知识 51 5.2 单个单元形态发生素模型的模拟电路实现 54 5.3 计算阵列形态发生素模型的模拟电路实现 58 5.4 本章小结 59 第六章 结束语 60 6.1 工作总结 60 6.2 研究展望 60 致 谢 62 参考文献 63 作者在学期间取得的学术成果 68 国防科学技术大学研究生院工学硕士学位论文 国防科学技术大学研究生院工学硕士学位论文 国防科学技术大学研究生院工学硕士学位论文 国防科学技术大学研究生院工学硕士学位论文 表 目 录 表 1.1 硬件容错与人体免疫系统的映射关系表 9 表 2.1 MPI 消息类型 23 表 2.2 中值滤波算法故障注入实验结果 25 表 2.3 Sobel 算法故障注入实验结果 30 表 3.1 记号含义及参考值 37 图 目 录 图 1.1 欧洲航天局(ESA)“曙光”计划路线图 2 图 1.2 胚胎电子系统的基本结构图 6 图 1.3 行消去修复法 7 图 1.4 细胞消去修复法 7 图 1.5 eDNA 结构的自我修复过程 8 图 1.6 人工免疫容错系统状态变迁示意图 9 图 1.7 本文的研究思路 10 图 2.1 靶细胞对蛋白质激素的识别 12 图 2.2 仿生自组织计算阵列的一般结构 15 图 2.3 仿生自组织计算阵列 DNA 的构造过程 16 图 2.4 细胞管理器各自的匹配表和细胞状态表 16 图 2.5 细胞管理器的数据匹配与分派算法 17 图 2.6 中值滤波示意图 20 图 2.7 中值滤波算法数据流图 21 图 2.8 中值滤波算法匹配表 22 图 2.9 中值滤波算法细胞状态表 24 图 2.10 阵列故障注入示意图 25 图 2.11 Sobel 边缘检测算法的 C 语言描述 27 图 2.12 Sobel 算法数据流图和 DNA 28 图 2.13 Sobel 算法各类细胞管理器的细胞状态表 28 图 3.1 形态发生素浓度梯度示意图 33 图 3.2 扩散-降解模型浓度梯度示意图 34 图 3.3 基于被动

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