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分子生物学综合
名词:
极性突变:在一个操纵子中,与操纵基因毗连的结构基因发生终止突变后,它除了影响该基因本身产物的翻译外,还影响其后结构基因多肽的翻译外,还影响其后的结构基因多肽的翻译,并且具有极性梯度的特征。
端粒:在染色体末端具有一种特殊的结构,它对维持染色体的稳定性起着十分重要的作用,这种结构被称为端粒。
摇摆假说:反密码子和密码子在一定范围内的可选择配对现象。
同功受体:负载同一种氨基酸,但识别不同密码子的tRNA。
顺式作用元件:基因序列中可在原位发挥作用并影响与其在物理上相连的基因表达的保守结构(DNA和RNA)。
分子伴侣:是一组以非共价连接方式参与多肽链的折叠、组装,但又不参与该肽链分子功能的蛋白质。包括热击蛋白和环境胁迫蛋白。
同工受体tRNA:能解读同义密码子的不同tRNA被定义为同工受体tRNA。
第二章:
顺反子理论:
基因(顺反子)是染色体上的一个区段,在一个顺反子内有若干个交换单位,最小的交换单位被称为交换子。在一个顺反子中有若干个突变单位,最小的突变单位被称为突变子。在一个顺反子的结构内,如果发生突变就会导致功能的丧失,所以顺反子只是一个具有特定功能的、完整的、不可分割的最小遗传单位。
全同等位基因:在同一基因座位中,同一突变位点向不同方向发生突变所形成的等位基因。
非全同等位基因:在同一基因座位中,不同突变位点发生突变所形成的等位基因。
影响双螺旋结构稳定性的因素
氢键;磷酸酯键;Na盐生理条件下,可有效屏蔽带较强负电荷的两条核苷酸链上磷酸基团间的静电斥力;碱基堆积力:疏水作用力和范德华作用力;碱基对之间的挤压,抵御可以使DNA分子的内能增加,氢键作用力被减弱。
DNA分子的复性影响因素:
Na+浓度;温度;长度;浓度;核苷酸的排列或核苷酸序列的复杂性
DNA的三级结构:
当施加外力后,将线状DNA的两端固定或连接成环状分子,这种不能被释放的张力只能通过使分子内部形成反向扭曲的方式而被抵消,从而使螺旋体的结构保持稳定,这种扭曲称为超螺旋。
正超螺旋:向右旋分子施加右旋外力,DNA出现向左旋的超螺旋结构。
负超螺旋:向右旋分子施加左旋外力,DNA出现向右旋的超螺旋结构。
L(DNA双链分子的交叉数)=T(DNA分子的初级螺旋数)+W(DNA形成的超螺旋数)
溴化乙啶(EB) DNA染料(紫外线激发,红光)负超螺旋变为正超螺旋
超螺旋数γ∕初级螺旋数β=超螺旋密度σ不同生物超螺旋密度几乎相同均为-0.05,是生活细胞维持部分DNA区域结构改变和整体稳定所必需的力学特征。
拓扑异构酶Ⅰ
原核生物ω酶 真核生物切缝酶切点C下游的第4个碱基处消除1个负螺旋 单链 p48
拓扑异构酶Ⅱ
原核生物螺旋酶或旋转酶α亚基磷酸二酯酶活性β亚基ATP酶活性引入2个负螺旋
双链 p49
间隔基因
真核生物的结构基因是由若干外显子和内含子序列相间隔排列组成的间隔基因。
外显子是指DNA上与成熟mRNA对应的核苷酸区段,或结构基因在DNA中的氨基酸编码区,或间隔基因中的非间隔区。
内含子是指结构基因中可转录但在mRNA成熟之前又被剪切的核苷酸区段,即DNA与成熟mRNA中的非对应区,或结构基因在DNA中的氨基酸非编码区,或间隔基因中的间隔区。
间隔基因存在的普遍性:
1 绝大多数结构基因是间隔基因,tDNA 和rDNA也是间隔基因。
2 间隔基因不仅是真核生物基因的主要结构形式,原核生物中也有间隔基因 的存在。
3 在某些低等真核生物的线粒体以及叶绿体基因中也发现了断裂现象,这种DNA和相应信使RNA结构上的差异在真核生物中是普遍的。
间隔基因的相同性:
1.间隔基因的外显子在基因中的排列顺序和它在成熟mRNA产物中的排列顺序是相同的。
2.某种间隔基因在所有组织中都具有相同的内含子成分。
3.核基因的内含子通常在所有的可读框中都含有,因此一般都没有编码功能。
4.大多数内含子上发生的突变不影响蛋白质的结构,但也有例外。
间隔基因形成的假说:
内含子先存论
内含子后生论
间隔基因在进化中的意义:
1 有利于生物遗传的相对稳定
2 增加变异概率,有利于生物的进化
3 扩大生物体的遗传信息储量
4 利用内含子进行代谢调节
转座 倒位/易位 特定的基因片段 断点随机的任意DNA片段可能破坏某结构基因 UV/诱变剂无效 UV/诱变剂可提高频率 高频率的回复突变形成易变基因 不能产生回复突变 转座需要转座酶,IR序列 Rec A,Rec B,Rec D等 与复制有关的过程 DNA链的断裂与错接的过程 第三章:
DNA复制的模式
⑴新起始方式或复制叉式每次复制的起始均从一个固定复制起点开始,转录激活作用使双链DNA开链,启动前导链的连续复制并在两个方向形成复制叉,后随链按不连续方式合成冈崎片段。
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