分子生物学 第四章 transcription elongation ppt.pptVIP

* After 100 Nt l????模板DNA中G/C的存在 delay l??? promoter clearance elongation complex TFII E, H, ATP, Negative-superhelix needed l????RNApol II + TFII F（helicase） Transcription 55kd TFII J stimulation elongation 4.3.1 Transcription delay(转录过程的延宕dang） 4.3 Transcription Elongation 4.3.2 Pre-mature termination of transcription —— RNA pausing 形成系列 调节机制 以降低非生理性，非特异性的基因表达 由于核小体致密的结构 l???? 3’-end 具有高亲和力结合的核蛋白质影响 l???? Silencer or DNA loop 结构的影响 l???? DNA分子的弯曲 延伸过程与两种transcription Complex 性质相关 l?? 进行型复合体 （processive complex） RNApol II stop at 3’-end of gene 并表现为DRBS (5,6-2氯-1-β-D呋喃核糖苯并咪唑) (5,6-dichloro-1-β-D ribofuranosyl benzimidazole) 被激活的基因的表达方式，其RNA能顺利延伸 l??非进行型复合体（Non-processive complex） 未被激活的基因的表达方式 RNApol II pausing at 5’-end of gene，并表现为DRBR --- 是对基因非激活转录的中止机制 --- 维持正常生理代谢进行的机制 --- 与转录启动复合体的非完整性有关（abortive TIC） e.g. Drosophila hsp70 gene 非热激条件下，RNA pausing at +14 or +42 e.g. C-mycP2 Null P MELa I site 非激活转录 激活转录 MELa I factor mRNA processing Pausing at +371 Terminator: A sequence of DNA, presented at the end of the transcript, that causes RNA polymerase to terminate transcription. 4.4 Transcription termination 4.4.1 Termination in prokaryotes Palindromic sequence G/C rich region that forms hairpins of varying lengths (7-20bp) in RNA G/C rich hairpin are followed by a run of U residues in RNA Structure Rho-independent terminator (Intrinsic terminator) Function G/C rich → transcription delay RNA stem-loop polyA/U →RNApol leave β’ inhibited by K factor → RNApol DNA separated β因子： 促进RNA pol + NTP → RNA elongation 完成 NMP之间的磷酸脂键的连接 Editing 与 Rho(ρ)因子竞争RNA 3’-end 构成Holo Enzyme后，β因子含有 两个位点 I site (Rif S) ; E site (Rif R) ; 要求高浓度的ATP or GTP 专一性地结合ATP or GTP 对 NTP 非专一性结合 β’ 因子： 强碱性亚基 促使RNA pol与非模板链（sense strand）强