中国苦槠边缘区和核心区种群遗传结构研究.pdfVIP

目 录 摘 要 I 1 前言 1 1.1 边缘种群的概念1 1.2 边缘种群与核心种群的比较1 1.2.1 种群结构的比较1 1.2.2 遗传结构的比较3 1.3 边缘种群的保护价值6 1.4 研究意义6 1.5 研究方法7 1.6 研究物种7 2 材料与方法 10 2.1 实验材料10 2.2 总 DNA 的提取10 2.2.1 主要的实验仪器10 2.2.2 实验试剂10 2.2.3 实验步骤11 2.3 基因组 DNA 的微卫星分析12 2.3.1 微卫星引物12 2.3.2 微卫星扩增程序13 2.3.3 微卫星扩增产物电泳检测14 2.4 统计分析15 2.4.1 连锁不平衡检验15 2.4.2 Hardy-Weinberg 平衡检验15 2.4.3 哑基因(Null alleles)的检测16 2.4.4 遗传多样性分析16 2.4.5 遗传分化分析18 2.4.6 瓶颈效应检测19 3 结果 21 3.1 连锁不平衡检验22 3.2 Hardy-Weinberg 平衡检验22 3.3 核心和边缘种群的遗传多样性24 3.3.1 平均等位基因数、等位基因丰富度24 3.3.2 观察杂合度和期望杂合度25 3.3.3 近交系数26 3.4 核心和边缘种群的遗传分化26 3.4.1 F-统计26 3.4.2 Nei’s 基因分化系数 27 3.4.3 分子遗传方差分析28 3.4.4 遗传一致度和遗传距离28 3.4.5 Mantel 检验 28 3.5 瓶颈效应检测29 4 讨论 30 4.1 边缘种群与核心种群遗传多样性的比较30 4.2 边缘种群与核心种群遗传分化的比较31 4.3 边缘种群的起源32 附 录 34 参考文献 37 致 谢 45 摘要 中国苦槠边缘区和核心区种群遗传结构的比较 摘 要 全球气候变化会使物种的地理分布向南北两极扩张或向高海拔转移，会对生物多样性带 来显著的影响。边缘种群通常处于恶劣的生境中，它们对气候的变化可能更为敏感，物种对 于环境变化的响应可能很大程度上取决于边缘种群的响应。“核心-边缘假说”预测边缘种群 与核心种群相比遗传多样性较低，遗传分化较高，边缘种群更倾向于灭绝。但是关于这个假 说仍然存在着很多争议。苦槠是常绿阔叶林的优势树种，其花粉主要靠风媒传播，本文以此 为研究对象，对核心种群和边缘种群的遗传结构进行比较，以探究在较大基因流存在的情况 下边缘种群的遗传多样性和遗传分化情况。 本研究选用了 7 对多态的微卫星引物，研究了 12 个核心种群和 5 个边缘种群共 482 个 个体。结果显示：边缘种群的平均等位基因数、等位基因丰富度并不比核心种群低，甚至更 高，边缘种群的平均期望杂合度和观察杂合度都要高于核心种群，并达到了显著程度。原因 是在气流作用下，种群间存在着大的基因流。苦槠花期在 4-5 月份，此时气流主要是向西北 方向，因此，边缘种群能够接受来自于核心种群的花粉，而核心种群却不能接受边缘种群的。 核心种群的基因分化系数(GST)为 0.142，边缘种群的 GST 为 0.091，边缘种群与核心种群 的遗传分化差异并未达到显著程度。AMOVA 分析表明，苦槠种群 81%的遗传变异来自于