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五核酸

DNA的存在形式 二、DNA的三级结构 DNA双螺旋的进一步扭曲构成三级结构,负超螺旋 原核 双链环状DNA(dcDNA) 病毒 单链环状DNA(scDNA) 单链线性DNA(ssDNA) 真核 双链线性DNA(dsDNA) RNA的结构与功能 一、结构特点 碱基组成 A、G、C、U (A=U/G≡C) 稀有碱基较多,稳定性较差,易水解 多为单链结构,少数局部形成螺旋 分子较小 分类 mRNA(hnRNA 核不均一RNA) tRNA rRNA (snRNA/asRNA) 少数RNA病毒 二、tRNA 占RNA总量的15% 一种氨基酸对应最少一种RNA 分子量25000左右,大约由70-90个核苷酸组成,沉降系数为4S左右。 分子中含有较多的修饰成分。 3-末端都具有CpCpAOH的结构。 tRNA的三级结构 三、rRNA 占RNA总量的80% 原核生物 真核生物 核糖体 rRNA 核糖体 rRNA 30s 70s 50s 16s 5s 、23s 40s 80s 50s 18s 5s、5.8s、28s 四、mRNA和hnRNA 占细胞总RNA的3%~5% 真核细胞mRNA的3‘-末端有一段长达200个核苷酸左右的聚腺苷酸(polyA),称为 “尾结构” ,5’ -末端有一个甲基化的鸟苷酸,称为” 帽结构“ 。 五、snRNA (small nucleic RNA 核小RNA) scRNA (small cytoplasmic RNA) asRNA (antisense RNA) 第四节 核酸的性质 一、一般的理化性质 两性解离 / 一般呈酸性(在中性溶液中带负电荷),微 溶于水,不溶于有机溶剂 线性大分子(粘度高。抗剪切力差) 可用电泳或离子交换(色谱)进行分离 室温条件下,DNA在碱中变性,但不水解,RNA水解 加热条件下,D-核糖+浓盐酸+苔黑酚 绿色 D-2-脱氧核糖+酸+二苯胺 蓝紫色 二、核酸的紫外吸收特性 在核酸分子中,由于嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键体系,因而具有独特的紫外线吸收光谱,一般在260nm左右有最大吸收峰,可以作为核酸及其组份定性和定量测定的依据。 以A260/A280进行定性、定量 DNA和RNA溶液中加入溴化乙锭(EB),在紫外下发出荧光 三、核酸的变性、复性与分子杂交 1. 变性 稳定核酸双螺旋次级键断裂,空间结构破坏,变成单链结构的过程。核酸的的一级结构(碱基顺序)保持不变。 变性表征 生物活性部分丧失、粘度下降、浮力密度升高、紫外吸收增加(增色效应) 变性因素 pH(11.3或5.0) 变性剂(脲、甲酰胺、甲醛) 低离子强度 加热 DNA的变性过程是突变性的,它在很窄的温度区间内完成。因此,通常将紫外吸收的增加量达最大量一半时的温度称熔解温度,用Tm表示。 一般DNA的Tm值在70-85?C之间。DNA的Tm值与分子中的G和C的含量有关。 G和C的含量高,Tm值高。因而测定Tm值,可反映DNA分子中G, C含量,可通过经验公式计算:(G+C)%=(Tm-69.3)X2.44 2. 热变性和Tm 3. 核酸的复性 变性核酸的互补链在适当的条件下,重新缔合成为双螺旋结构的过程称为复性。 DNA复性后,一系列性质将得到恢复,但是生物活性一般只能得到部分的恢复,具有减色效应。 将热变性的DNA骤然冷却至低温时,DNA不可能复性。变性的DNA缓慢冷却时可复性,因此又称为“退火”。 退火温度=Tm-25℃ 复性影响因素 片段浓度/片段大小/片段复杂性(重复序列数目)/ 溶液离子强度 4.分子杂交 DNA单链与在某些区域有互补序列的异源DNA单链或RNA链形成双螺旋结构的过程。这样形成的新分子称为杂交DNA分子。 核酸的杂交在分子生物学和遗传学的研究中具有重要意义。 Southern 杂交(Southern bolting) Northern 杂交(Northern bolting) Western 杂交 (Western bolting) 四、核酸的序列测定 双脱氧链终止法(Sanger酶法) 2. Gilbert化学降解法 本 章 小 结 核酸是遗传物质载体的证明和研究历史 核酸的化学结构:戊糖、碱基(A、T、G、C、U),核苷、核苷酸及其衍生物的结构特点(原子编号) DNA的结构:一级结构(核酸序列及其表示、基因及基因组、序列测定)、二级结构(

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