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2009信息学会 2009信息学会 * 2009信息学会 * 方差分析的缺陷 优点 简单: 标准统计软件 灵活: 可以分析各种已知的效应 缺点 假阳性，检验功效低 受群体分层的影响 解决办法 提高阈值: Bonferroni t test 换用其它的分析方法: TDT 第1页/共17页 * 2009信息学会 * 原理 Xu(1995) 第2页/共17页 * 2009信息学会 * 混杂的概念 HLA座位的A1等位基因与用筷子吃饭能力 用筷子吃饭: A1等位基因频率95%, 中国人 不用筷子吃饭: A1等位基因频率5%, 白人 人种为混杂因素 家畜 非随机交配, 引种等 第3页/共17页 * 2009信息学会 * TDT TDT Transmission disequilibrium test 当存在连锁时, 检验是否存在关联 不受群体分层等的影响 风险因素(risk factor) 影响疾病的座位 第4页/共17页 * 2009信息学会 * TDT 原理 比较传递了某个等位基因的个体和没有传递某个等位基因的个体 可用于只有两个等位基因的座位和多个等位基因的座位 第5页/共17页 * 2009信息学会 * 病例-对照设计 病例 对照 + - + a b - c d “+”表示风险因素存在, “-”表示风险因素不存在. a 和 d 不提供任何信息. 已知 b + c 的总数