4个地区独一味ITS基因片段序列分析.docVIP

4个地区独一味ITS基因片段序列分析 　　[摘要] 目的：检测独一味的ITS基因序列片段，并利用ITS序列作为遗传标记分析了来自4个不同地区(甘南玛曲、西藏林芝、四川若尔盖道班、四川若尔盖热当坝)的独一味的遗传变异情况。方法：采用Plant DNA Mini Kit法作为基因组DNA提取的最佳方法，提取植物独一味的核基因组DNA，并且建立了适合独一味的PCR反应体系，利用合成的特异性PCR引物对所提取的DNA中rRNA基因内转录间隔区序列进行套式扩增，扩增产物经琼脂糖凝胶电泳得到电泳图谱，并进行分析，测序。经Clusta 1X软件排序，MEGA3软件统计分析和分支分析，建立系统发育树，并计算各类群间的遗传距离。结果：琼脂糖电泳图谱及所测序列显示，来自于植物独一味的核DNA中rRNA基因内转录间隔区全长为670bp左右，甘南玛曲和西藏林芝的独一味遗传距离较小，四川与甘南玛曲和西藏林芝的独一味遗传距离较大。结论：基于ITS序列分析，??为品质突出的甘南玛曲独一味和其他地区的独一味相比，并未形成一个区别于其他地区独一味的一个独特的种。根据ITS序列特征所构建的系统树，与传统分类有所不同。 　　[关键词] 独一味；PCR；ITS序列；分子系统进化 　　[中图分类号] R931 [文献标识码]A[文章编号]1674-4721（2011）06（a）-０05－０3 　　 　　Anal