基于最小能量模型rna二级结构预测-prediction of rna secondary structure base on minimum energy model.docxVIP

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2018-08-14 发布于上海
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基于最小能量模型rna二级结构预测-prediction of rna secondary structure base on minimum energy model.docx

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基于最小能量模型rna二级结构预测-prediction of rna secondary structure base on minimum energy model

独创性声明本人声明，所呈交的学位（毕业）论文，是本人在指导教师的指导下独立完成的研究成果，并且是自己撰写的。尽我所知，除了文中作了标注和致谢中已作了答谢的地方外，论文中不包含其他人发表或撰写过的研究成果。与我一同对本研究做出贡献的同志，都在论文中作了明确的说明并表示了谢意，如被查有侵犯他人知识产权的行为，由本人承担应有的责任。学位（毕业）论文作者亲笔签名：日期：论文使用授权的说明本人完全了解福建农林大学有关保留、使用学位（毕业）论文的规定，即学校有权送交论文的复印件，允许论文被查阅和借阅; 学校可以公布论文的全部或部分内容，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。保密，在年后解密可适用本授权书。□ 不保密，本论文属于不保密。□学位（毕业）论文作者亲笔签名：日期：指导教师亲笔签名：日期：目录摘要 ...................................................................................................................... 1Abstract21引言 .................................................................................................................... 11.1 研究的目的和意义...................................................................................... 11.2 研究现状..................................................................................................... 21.3 论文的结构安排 ......................................................................................... 52RNA 的相关理论62.1 RNA 的基本知识6RNA 的构成6RNA 的分类与结构8RNA 的功能 132.2 RNA 的二级结构 132.2.1 RNA 二级结构的定义 132.2.2 RNA 二级结构的基本子结构 132.2.3 RNA 二级结构的表达方式 152.2.4 RNA 二级结构的热力学模型 182.3 本章小结....................................................................................................213RNA 二级结构预测方法的对比与分析 223.1 序列比对分析方法.....................................................................................22CM 22SCFG 233.2 基于最小自由能模型的预测方法 .............................................................243.2.1 Zuker 的最小自由能算法 243.2.2 遗传模拟退火算法...........................................................................273.2.3 神经网络算法...................................................................................283.2.4 免疫粒子群算法...............................................................................293.3 当前已有的 RNA 结构预测软件303.4 本章小结....................................................................................................314混合 Hopfield 神经网络预测 RNA 二级结构 324.1 RNA 二级结构的数学模型 324.2 Hopfield 神经网络算法与禁忌搜索算法 344.2.1 Hopfield 神经网络 344.2.2 禁忌搜索算法................................