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04 基因表达调控PPT
(1)外显子选择(optional exon) (2)内含子选择 (optional intron) (3)互斥外显子(mutually exclusive exon) (4)内部剪接位点(internal splice site) 2.选择剪接对基因表达的调控作用 (1)Bax基因转录产物的选择剪接 Bax基因的编码产物是与细胞凋亡有关的分子 Bax基因编码产生的蛋白质有几种(α、β、γ等),结构略有差异,差异的产生来自于mRNA的选择剪接。 alternative splicing of mRNA from bax gene (2)选择剪接产生的IκBγ NF-κB是一种广泛存在的反式作用因子,可与很多基因的上游启动子元件或增强子内部的κB元件结合而调节基因的表达。 ? NF-κB与IκBγ结合时,以无活性的NF-κB/IκBγ复合体(105 kD)存在于胞浆。 IκBγ基因表达时,通过选择剪接,使IκBγ mRNA中的178个或67个密码子删除,引起阅读框架移动,产生两种具有新C末端的蛋白异构体,即IκBγ1和IκBγ2。 在IκBγ1和IκBγ2中缺失了一个蛋白激酶 A 识别位点,该位点的磷酸化调节IκBγ的活性。 mRNA的编辑(mRNA editing) 指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入、丢失或转换等现象,是在mRNA水平改变遗传信息,能改变表达产物的性质。 原生细胞线粒体细胞色素氧化酶亚基 II基因转录后的RNA编辑 DNA 5‘—AAA GTA GAG AAC CTG GTA---3’ --- Lys Val Glu Asn Leu Val --- 编辑后mRNA-AAA GUA GAU UGU AUA CCU GGU --- Lys Val Asp Cys Ile Pro Gly-- ? RNA编辑作用说明,基因的编码序列经过转录后加工,是可有多用途分化的,因此也称为分化加工(differential RNA processing)。 人类apoB基因 mRNA(14500个核苷酸) 肝脏 apo B100 (分子量为500,000) 肠道细胞 apo B48 (分子量为240,000) mRNA编辑 机制:尚不清楚。研究人员已经发现线粒体转录一类特殊的RNA分子,其3?端有一段 poly(U), 其5?端序列与mRNAs被编辑的区域互补,被称为引导RNA(guide RNA)。引导RNA可能作为编辑过程的模板,并将其3?端的U转移给被编辑的mRNAs。 (三)mRNA运输的控制 mRNA的运输是受到控制的。 mRNA通过核膜的运输是一个主动运输过程,核膜上的核孔是大约9-nm的通道,但可以运输大于9 nm的颗粒,如核糖体(15 nm)。核糖体均在核内组装,再运输到胞浆。RNA从核运输至胞浆的运输调控的机理目前还不清楚。 转录起始复合物的形成: T82A97T93A85(A or T)100A83(A or T)83 效率 ? H E A TBP B F J (二)反式作用因子 1.反式作用因子(trans-acting factor) 真核细胞内含有大量的序列特异性的DNA结合蛋白,其中一些蛋白的主要功能是使基因开放或关闭,称为反式作用因子。 反式作用因子识别特定的DNA序列(通常8~15个核苷酸),与DNA结合后,可以促进(正调控)或抑制(负调控)一个邻近基因的转录。 2.反式作用因子的主要特点 ① 一般具有三个功能结构域: DNA识别结合域,转录活性域,结合其他蛋白的结合域。 ② 能识别并结合上游调控区中的顺式作用元件。 ③ 对基因表达有正性和负性调控作用,即激活和阻遏基因的表达。 3. 反式作用因子结构域的模式 (1)DNA结合域(DNA-binding domain) 1)锌指结构 2)同源结构域 3)亮氨酸拉链结构 4)螺旋-环-螺旋结构 5)碱性α-螺旋 1)锌指结构(zinc finger motif) 是指DNA结合域中含有较多半胱氨酸和组氨酸的区域,借肽链的弯曲使 2 个 Cys和 2 个 His 或4 个 Cys 与一个 Zn++ 络合成的指状结构。 Zn Cys
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