蛋白质二级构造预测方法研究.pdfVIP

摘要 随着人类基因组计划的完成，人们已经获得了大量生物的遗传信息，数以万 中总共收集了148516条已被测序的蛋白质序列。然而一条蛋白质序列必须折叠 成一定的空间结构时才能发挥它特定的生物功能，人们在对蛋白质序列测序完成 之后更希望的是得到这些蛋白质的空间结构，以便发现结构与功能之间的联系。 因此，蛋白质结构和功能的研究就成为了后基因组时代生命科学领域人们研究的 主要任务和目的。 目前，通过实验的方法获得的蛋白质结构序列只有两万多条(2004年4月 20日，PDB数据库中共收集了25176条)，远远落后于蛋白质序列的测序速度， 因此理论预测蛋白质结构势在必行。然而，直接从蛋自质一级序列预测其三维空 间结构时人们又遇到了诸多困难。在对蛋白质分子的仔细研究和分析后发现由二 级结构组装面成的空间结构是有限的。因此，如果能从蛋白质一级序列先预测出 二级结构，再由二级结构预测三级结构便成为一条有效的途径。这里，蛋白质二 级结构预测不仅成为联系蛋白质一级序列和三级结构的纽带，而且也是从一级序 列预测其三维空间结构的关键步骤。 本文的主要工作是蛋白质二级结构预测方法的研究，具体工作概括如下： 1．从上世纪60年代中期至今，蛋白质二级结构预测已经发展了40年的时间，