RNA组学PPT.pptVIP

其长度一般为20~25个碱基； 在不同生物体中普遍存在； 其序列在不同生物中具有一定的保守性； 具有明显的表达阶段特异性和组织特异性； miRNA 基因以单拷贝、多拷贝或基因簇等多种形式存在于基因组中，大多位于基因间隔区。 miRNA的特点： 小干扰RNA：是细胞内一类双链RNA(double-stranded RNA，dsRNA)在特定情况下由Dicer（RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶）加工而成。具有特定长度(21~23个碱基)和特定序列的小片段RNA。 双链siRNA参与RISC组成，与特异的靶mRNA完全互补结合，导致靶mRNA降解，阻断翻译过程。 由siRNA介导的基因表达抑制作用被称为RNA干涉(RNA interference，RNAi)。 SiRNA 30bp 双链RNA（dsRNA） 水解生成 21-23nt siRNA 5’ 3’ 3’ 5’ RISC形成 识别特异序列 并使其降解 RNA干扰作用机制 RNA干扰作用机制 siRNA miRNA 前体 内源或外源长双链RNA诱导产生 内源发夹环结构的转录产物 结构 双链分子 单链分子 功能 降解mRNA 阻遏其翻译 靶mRNA 结合 需完全互补 不需完全互补 生物学效应 抑制转座子活性和病毒感染 发育过程的调节 siRNA 和miRNA的差异比较 miRNA与siRNA作用机制的比较 基因组学领域的分类 根据生物系统特征分类 结构基因组学 (Structural genomics) 功能基因组学 (Functional genomics) 基因组图谱绘制、测序 基因和基因组组织 基因组调节 网络结构 蛋白质结构特征 转录组学(Transcriptomics) 蛋白质组学(Proteomics) 代谢组学(Metabolomics) DNA　　　　　　 　RNA　　　　　　PROTEIN 基因组　　 转录组　　　 蛋白质组 基因组学　　　　 转录组学　　　　蛋白质组学 基因组、转录组和蛋白质组 基因组 转录组 蛋白质组 化学生物学 人： 30,000 果蝇和线虫：12,000-14,000 酿酒酵母： 6,200 假单孢菌： 5,500 人和鼠的蛋白质编码基因99%是共同的。 人个体间单倍体基因组的碱基差异300万个，其中1万个（0.3%）出现在蛋白质编码基因中，且绝大多数存在于第3字母。98%转录物是非编码蛋白RNA。 2倍 2倍 编码蛋白质的基因数量 基因数量 → 生物复杂性？ 1. 基因数量的变化，无法解释生物学功能、调控机理以及物种多样性和复杂性的巨大变化 2. 当前解释：蛋白质组的多样性和复杂性 ? 物种的多样性和复杂性；～10,000,000种蛋白质分子 3. 两种观点： a. 转录后层面，mRNA剪切，产生拼接异构体 b. 蛋白质层面，蛋白质序列上一个或多个位点上发生的翻译后修饰 生物化学与分子生物学系 陈瑜 RNomics 1953年 DNA双螺旋结构的解析掀起了在 RNA转录和翻译水平解读遗传信息的高潮, 导致mRNA, tRNA和rRNA的发现以及遗传密码和“中心法则”的建立. 1977 年分裂基因(split gene)的发现极大地促进了在 RNA 转录后加工水平解读遗传信息表达的过程及机制, 深入解析了mRNA, snRNA,snoRNA 和 gRNA 的结构与功能,提出了RNA 剪接、编辑以及核酶(ribozyme)和“RNA世界”等新的概念. Central Dogma of Biology Genotype to Phenotype DNA RNA 蛋白质 基因组学 RNA组学 蛋白质组学 随着基因组与基因组学这两个术语的流行，一系列新的术语也被创造出来，每个新的研究领域被冠以“……组学”（-omic)的名称，而被研究的对象则被称为“……组”（-ome)。其中最常用的： 传统观念认为：三类最重要的生物高分子化合物中，DNA携带遗传信息，蛋白质是生物功能分子，而RNA在这二者间起传递遗传信息功能（即参与蛋白质的生物合成）。 20世纪80年代初，T．Cech发现RNA也可成为生物催化剂，称之为核酶(ribozyme)。核酶的发现打破了多年来“酶的化学本质就是蛋白”的传统观念。 人们认识到，RNA的生物功能远非传递遗传信息那么简单。 RNA领域的新发现： 1、RNA控制着蛋白质的生物合成； 2、RNA具运动功能； 3、RNA具调控功能；（性染色体17kbrna与结合，灭活） 4、RNA调控遗传信息；（不同方式的rna剪接—新的遗传信息、编辑） 5、RNA修饰；（甲基化