syxDING 分子标记PPT.ppt

青海师范大学 生地学院 孙玉侠、余 涛; 遗传标记的类型及发展;何为分子标记？;分子标记技术可用于：;DNA分子标记的优势;理想分子标记的界定;分子标记技术;RFLP标记技术（限制性片段长度多态性 ）;流程图;;;利用随机合成的寡聚核苷酸序列（8～10bp）作为引物，对所研究的基因组DNA进行PCR扩增。 扩增产物在琼脂糖凝胶或丙烯酰胺凝胶上电泳分离，并经溴化乙锭染色或银染色得到多态性的DNA图谱。 ;实验步骤;应用;AFLP标记技术（限制片段选择扩增技术）;;应用;第2代分子标记 ; SSR 分子标记由Lit t M ,等于1989 年创建的。简单重复序（SSR）也称微卫星DNA，其串联重复的核心序列为1一6 bp，其中最常见是双核苷酸重复，即（CA) n和（TG) n每个微卫星DNA的核心序列结构相同，重复单位数目10一60个，其高度多态性主要来源于串联数目的不同。SSR标记的基本原理：根据微卫星序列两端互补序列设计引物，通过PCR反应扩增微卫星片段，由于核心序列串联重复数目不同，因而能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物，将扩增产物进行凝胶电泳，根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。 ; SSR具有以下一些优点：（l）一般检测到的是一个单一的多等位基因位点；⑵微卫星呈共显性遗传，故可鉴别杂合子和纯合子；⑶所需DNA量少。显然，在采用SSR技术分析微卫星DNA多态性时必须知道重复序列两端的DNA序列的信息。如不能直接从DNA数据库查寻则首先必须对其进行测序。 ;ISSR标记技术 （ 内部简单重复序列）;第三代分子标记;SNP标记技术（单核苷酸多态性）;应用;EST标记技术;可代表生物体某种组织某一时间的一个表达基因， 所以被称之为“表达序列标鉴”； 而FBT的数目则显示出其代表的基因表达的拷贝数， 一个基因的表达次数越多，其相应的cDNA克隆越多， 所以通过对cDNA克隆的测序分析可以了解基因的表 达丰度。;分子标记技术的发展;另外，由于氨基酸密码子的兼并性，这种差异可以导致沉默突变而不影响氨基酸的翻译，在表型上没有变化。;谢谢老师和同学们，请指导