双向电泳实验PPT
双 向 电 泳;基因组学与蛋白质组学;Applications of proteomics;蛋白质组分析的首要要求;生物学问题的提出;一、样品制备;增加样品溶解性的手段;4、起载体作用的两性电解质:某些蛋白质需要在盐离子的作用下才能保持其处于溶解状态,否则这些蛋白质在其处于PI点时会发生沉淀。
Carrier ampholytes的作用在于捕获样品中的少量盐分,从而保证蛋白质的溶解性。应用时,两性电解质的浓度应小于0.2%(w/v)。浓度过高会使IEF的速度降低。另外,为了保证实验的精确性,在选择不同pH范围的IPG胶条时,也应使两性电解质的pH值与之相符合。;可溶性样品 ;常用细胞裂解液;特殊样品的制备;强碱性蛋白质(如核糖体 )的处理:先将蛋白预处理以富集,再用特殊pH梯度的IPG胶条(如pH3-12、4-12或10-12)进行等电聚焦。其中窄范围碱性IPG胶(如pH10-12)的挑战是克服反向、阴极向阳极、电渗流和水平条纹模式,而宽范围的碱性IPG胶(如pH3-12、4-12)等消除了窄范围胶所需要的专门水化液。
极端分子量的蛋白质:小于8kD和大于200kD的蛋白在常规IPG-2D上不易看到,这可能是在Tris/glycine缓冲液中,样品和游离的dodelcyl sulfate ions持续积累浓缩,与小分子量的蛋白质发生对流混合,产生茸毛
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