翘嘴鳜肌球蛋白重链(myhc)基因克隆及其特征的分析课件.pdfVIP

摘要 摘 要 肌球蛋白重链(MyHC)是骨骼肌的主要结构和收缩蛋白。本文以翘嘴鳜背 侧白肌为实验材料，采用Trizol法提取白肌总RNA，然后反转录合成单链cDNA 为模板，根据Genbank数据库中相近物种的MyHC基因保守序列，设计三对引 物，分别通过三组PCR克隆、产物测序、序列拼接后获得翘嘴鳜肌球蛋白重链 基因的完整开放阅读框。 酸所占的比例比较大，总体上翘嘴鳜肌球蛋白重链属于疏水性蛋白。翘嘴鳜肌 性和强酸性氨基酸含量差别不太大。密码子统计分析也表明：翘嘴鳜肌球蛋白 重链cDNA的碱基组成不存在明显的偏好性，但是整个cDNA序列中C和T碱 基含量较低，仅分别为20．9％和20．31％。同时，各个位点的碱基含量也各不相 同，第一位碱基具有较高的A和G碱基(35．1％，37．1％)，第二位具有较高的A 碱基(43．8％)，第三位具有较高的G碱基。 三个ATP结合位点、三个actin结合位点和两个Loop表面环。通过氨基酸序列 比对发现，翘嘴鳜MyHC的S1、S2和LMM三个区域与大眼鳜、白姑鱼和鲤鱼 同源性。其中三个ATP结合位点和三个actin结合位点高度保守，而两个Loop 表面环保守性较低。 1．83和