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第6章 核酸的分离与纯化PPT
第六章 核酸的分离与纯化 ;第一节 核酸分离与纯化的设计与原则 ; 核酸的存在形式(DNA) ; 核酸的存在形式(RNA);一、材料与方法的选择 ;(三)影响核酸完整性的因素 ;二、技术路线的设计 ; (二)核酸的分离与纯化 ;核酸与其它物质的差异 ;应该去除的污染物 ;(三) 核酸的浓缩、沉淀与洗涤 ;三、鉴定与保存 ;(二)核酸的保存---DNA的保存 ;(二)核酸的保存---RNA的保存;核酸小量分装保存:
由于反复冻融产生的机械剪切力对DNA与RNA核酸样品均有破坏作用,在实际操作中,最好将核酸小量分装保存。 ;第二节 基因组DNA的分离与纯化 ;EDTA:为二价金属离子整合剂,可以抑制DNA酶的活性,同时降低细胞膜的稳定性。
SDS:为生物阴离子去污剂,主要引起细胞膜的降解并能乳化脂质和蛋白质。并使它们沉淀,同时还有降解DNA酶的作用。
无DNA酶的RNA酶:可以有效水解RNA而避免DNA的消化。
蛋白酶K:有水解蛋白质的作用,可以消化DNA酶和细胞中的蛋白质。
酚:可以使蛋白质变性沉淀,也抑制DNA酶的活性。
pH8.0的Iris溶液:能保证抽提后DNA进入水相,而避免滞留于蛋白质层。 ;(二)甲酰胺解聚法 ;(三)玻棒缠绕法
(四)其它方法
异丙醇沉淀法:
玻璃珠吸附法:
各种方法的取舍、蛋白酶K与RNA酶的使用与否要根据需要小心选择。 ; 碘化钾法抗凝血DNA提取(遗传中心)
↓取抗凝血500μl于1.5ml EP管(4管)
↓加重蒸水至1500μl
↓8000r/min 离心3min,弃上清(4管白细胞合并)
↓加80μl 5mol/L KCl,旋涡振荡30S
↓加9g/L NaCl400μl,混匀
↓加600μl氯仿,旋涡振荡30S
↓10000r/min离心5min,取上清400μl
↓加异丙醇240μl
↓40C 10000r/min离心12min,弃上清
↓500μl 4℃ 无水乙醇洗一次
↓40C 10000r/min离心5′,弃上清
●擦干,37℃干燥2-3min,80μl 1×TE混匀溶解配备。 ;(五)DNA样品的进一步纯化 ;二、DNA片段的回收 ;三、基因组DNA分离纯化的 方法学评价与质量保证 ;第三节 质粒DNA的提取与纯化 ;质粒DNA的纯化 ;二、质粒DNA的回收
常通过凝胶电泳分离并回收。有关回收方法与本章第二节中DNA片段的回收方法相同。
三、质粒DNA提取纯化的方法学评价与质量保证
(一)方法学评价
(二)质量??证 ;第四节 RNA的分离与纯化 ;一、RNA制备的条件与环境 ;3、防止RNase对RNA的水解原则:;二、总RNA的分离与纯化: ;三、mRNA的分离与纯化 ;本章总结
●核酸分离与纯化的设计与原则:
核酸一级结构的完整性;
尽量排除其它分子的污染,保证核酸样品的纯度。
●影响核酸完整性的因素:
可以避免的有害因素:过酸或过碱、高温加热
无法避免的有害因素:步骤、时间、核酸酶
●技术路线的设计:
核酸的释放、
核酸的分离与纯化、
核酸的浓缩、沉淀与洗涤 ;●鉴定与保存:
浓度鉴定、纯度鉴定、完整性鉴定
紫外分光光度法、荧光光度法
●基因组DNA的分离与纯化:
酚抽提法、
甲酰胺解聚法、
玻棒缠绕法
其它方法
●质粒DNA的提取与纯化
●RNA的分离与纯化:
RNA制备的条件与环境、
防止RNase对RNA的水解原则 ;作业
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