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非变性聚丙酰胺凝胶电泳
非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
4.1 清洗玻璃板、灌胶用量筒和烧杯,玻璃板气干(制胶用玻璃板为硫化玻璃,灌胶面必须干净无水分,否则灌胶时容易产生气泡;烧杯、量筒和玻璃板如果有水,由于胶与水不相溶,易使胶不能牢固粘在玻璃板上);
4.2将平口玻璃板和凹口玻璃板放在桌面的支撑物(瓶盖等)上,给玻璃板滴少量100%乙醇,用质量好的纸均匀擦洗制胶面,气干;
4.3 平口玻璃板和凹口玻璃板的三个边均匀的涂抹适量凡士林(凡士林太多不容易清洗);放上需要厚度的板条,此步应注意密封好板条的相接处,用手将三边和接茬处按牢固,否则容易漏胶;然后用夹子(夹子夹在板条中间)将玻璃板固定于灌胶架上;
4.4 配胶(8%非变性聚丙烯酰胺凝胶,Acr:Bis=37.5:1)、灌胶;
将以下母液按量混合均匀保存于4℃,一般一周内用完,
溶 液 120ml 240ml
40%Acr 24ml 48ml
2%Bis 12.84ml 25.68ml
10XTBE(8.3) 12ml 24ml
ddH2O 70.8ml 141.6ml
针对所选用的胶的大小和厚度量取适量以上混合液倒入干净烧杯,加入适量10%APS(催化剂)和TEMED(加速剂),摇匀,灌胶,缓慢插入与胶厚度一致的梳子,同时避免梳齿下产生气泡,待胶凝固;(注:1 聚丙烯酰胺凝胶在凝固以前有毒,凝固后无毒,因此操作时应戴上手套; 2 板条和梳子厚度必须一致,否则将在点样孔中产生胶膜,影响点样和最后电泳质量)
对于20cm x 17cm的玻璃板,除去板条尺寸,胶为16.5cm(宽) x 15.5cm(高) x 1mm(厚),
配制如下:
胶混合液 10%APS TEMED
一板胶 30ml 180μL 80μL
两板胶 60ml 360μL 160μL
制胶及电泳
(1)胶板的准备:首先确定两块玻璃板是否平整,用去污剂和清水将玻璃板洗涤干净,并用蒸馏水冲洗,用95%乙醇擦拭。
用 ml 95%的乙醇长玻璃短玻璃1ml配置好的亲和硅烷均匀分布于长玻璃面,1ml配置好的剥离硅烷均匀分布于长玻璃面,用ml 95%的乙醇长玻璃短玻璃取0.4mm的边条,置于左右两侧,将短玻璃板压于长玻璃板上,用夹子固定住两侧;以1×TAE配制1%琼脂糖凝胶封住玻璃板底部,用胶带密封;将玻璃板小角度倾斜放置,准备灌胶。
(2)制胶:称取尿素21g加入双蒸水加热溶解,待冷却后加入10ml 5×TBE,7.5ml 40%丙烯酰胺,225μl 10%过硫酸铵和50μl TEMED,,准备灌胶。
(3)灌胶:将制备的胶液沿玻璃板缓慢胶板的空隙,注意不能在胶中形成气泡。胶灌满后,将鲨鱼齿的平端插入胶液下5mm左右,同时防止平端下方出现气泡,于室温下静置h,使胶完全聚合。
(4)预电泳:撕去胶布,拔出,用蒸馏水玻璃板、梳子。1×TBE至没过1×TBE至没过反转,将鲨鱼齿插入凝胶胶面下约0.5mm,梳齿间即加样孔。120w恒功率,预电泳30min。
(5)点样:点样前用加样枪吹吸每个上样槽,将吸干净,以利于样品更好的沉降。把DNA样品与上样缓冲液混合,每个加样孔加5~7μl的扩增产物。
(6)电泳:140-160w恒功率电泳,待溴酚蓝至胶的四分之三处时(大约需要1.5~2h),终止电泳电泳液,取下胶板,将两块玻璃板轻轻分开,胶留在长玻璃板上。
6.1 当第一染料接近胶底边缘,电泳结束,也可使第一染料跑出;关闭电泳仪,移去夹子,取下玻璃板,将胶从玻璃板上小心取下,切去一角或两个角作为记号,以便于辨认,然后开始银染处理,处理均在摇床上进行,具体步骤如下:
10%醋酸(Fix/stop solution) 20分钟
纯水 15分钟
0.2%硝酸银(染液) 30分钟
纯水 10-20秒左右
显影液(Developer solution, 4-10℃) 显影适当
定影液(3%或10%醋酸,加几滴甘油) 5分钟
包胶
注:定影液——将胶在10%的醋酸中处理结束,可向醋酸中加入少许甘油(防止胶在干燥过程中发生胶裂),摇匀
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