酶筛选策略62中国药科大学药物筛选课件.pptVIP

43KD 66KD Fluorescence resonance energy transfer (FRET) assays Drug screen with FRET IC50 = 1.52E-06 例子 2： Exploration of SARS_3CL Proteinase Small Molecular Inhibitor 1. Envelope protein（E）(9.1 KD) 2. Nuclear Capsid Protein (N) (50 KD) 3. Spike Protein （S）(149KD) 4. 3CL Proteinase （3CL)(36KD) 5. M protein ( M ) (26 KD) 6. RNA Polymerase (110 KD) . . (1) Bioinformatics 利用生物信息技术，分析SARS病毒3CL基因与人和猪冠 状病毒3CL基因系列的同源性，构建SARS病毒3CL蛋白 酶高质量的3维蛋白质结构模型。利用分子动力学模拟确 定该蛋白酶的水解活性构像，建立药物活性口袋的分子表 面，以供进一步的计算机药物设计使用。 (2) Virtual Screening 利用超级计算机对现有的上市药物（8,000个）、在研的半 胱氨酸蛋白酶抑制剂（80个）、国家新药筛选中心化合物 样品库（10,000个）、商业化合物样品库（120,000个）和 中国天然产物分子库(45,000个)进行快速的计算机筛选； 提供500个左右化合物供进一步实验研究。 (3) Cloning, expression and purification of SARS_3CL proteinase SARS_3CL蛋白酶表达质粒构建、酶的表达和纯化。 (4) SARS_3CL proteinase ligand discovery 表面等离子共振生物传感器（SPR）Biacore 3000, S51。 MicroCal ITC。 KD (KA) ka, kd (5) SARS_3CL proteinase inhibitor investigation Substrate (S) SARS_3CL proteinase Read IC50 (6) Anti-SARS reagent discovery P3 Lab. A B C D Uninfected cells. (B) Infected cells without compound treatment. (C) Infected cells treated with 30 mg/L DC118. (D) Infected cells treated with 10 mg/L DC118. 四、受体小分子激动剂筛选 受体（receptor) 能与相应的药物结合并发生效应的特殊生物大分子 激素、递质 药物 受体 效应器 离子或分子的 传输，酶的激 活或失活，激 素或递质的释 放 生 物 效 应 受体激动及其产生效应的基本模式 “现代生化药学” （吴梧桐 主编 中国医药科技出版社，202年） 激动剂 （agonist)、拮抗剂 （antagonist)、部分激动剂 （partial agonist) 受体的基本特征：特异性、饱和性、可逆性 * * 三、酶抑制剂筛选 I. Introduction 代谢通路 脂质代谢 信号转导 蛋白质加工 炎症反应瀑布 药 靶 药 物 酶 1998年世界首次上市的新药 (中国医药资讯网 ) 　　1998年世界首次上市的新药有新活性物质(new active substances,NAS)与新化学物体(new chemical entities)共计46个。上市最多的国家是美国(32个)，其他依次为日本和德国(各4个)，瑞士(2个)，意大利、瑞典、新西兰和墨西哥(各1个)。　　按疗效分类，上市最多的为抗感染类药物，共11个(23.91%)，其他依次为心血管系统药物和消化系统用药各6个(各13.04%)，抗炎药3个(6.52%)，抗肿瘤药和神经系统药各2个(各4.35%)，其他药物16个(34.79%)。 表1　1997年世界首次上市的新药 (中国医药资讯网 ) 新药