裂殖酵母比较功能基因组学.docxVIP

PAGE6 / NUMPAGES6 裂殖酵母的比较功能基因组学 裂殖酵母菌属包括粟酒裂殖酵母(S.pombe)，八胞裂殖酵母(S. octosporus)，嗜冷裂殖酵母(S. cryophilus)和刺参裂殖酵母(S. japonicus)。它们占了子囊菌纲的基本分支并且是真核细胞生物学的一个重要模型。比较这些基因组的注释，我们发现了濒临灭绝的转座子并展开了自由转座子着丝粒方面的创新。表达分析确定了减数分裂基因在营养生长期服从反义转录，这表明了它们严格的调控机制。此外，反式作用调节因子可控制扩展功能模块范围内的减数分裂和应激反应的新基因。基因的内容和调控的差异可以解释为什么不同于酵母菌亚门的芽殖酵母，裂殖酵母不能使用乙醇作为主要的碳源。这些分析阐明了裂殖酵母的基因组结构和基因调控并为整个裂殖酵母菌属的研究提供了工具。 裂殖酵母菌种裂殖酵母在具有与众不同的生活史的子囊菌（图1A）里形成了一个广泛而古老的群体(1)。裂殖酵母作为单倍体优先生长，以二分裂而不是不对称出芽的方式增殖，并且已形成了一种独立于芽殖酵母（酵母菌亚门）的单细胞生物生活方式。裂殖酵母与后生动物拥有许多相同的重要生物过程，包括染色体的结构和代谢——染色体相对较大，多重复性的着丝粒，低复杂度的复制起点，异染色质组蛋白甲基化修饰，染色质异染色质蛋白，小分子干扰RNA(siRNA)调控的异染色质，和TRF家族端