lncrna全国讲座课件.pptxVIP

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lncrna全国讲座课件

“Learner Nontrivial Confidence” - RNA ——长链非编码RNA研究思路施沫全国技术中心 技术支持经理上海其明信息技术有限公司“You start projects and you have no idea what to expect. It’s that kind of challenge that I enjoy very much as a scientist.”LearnerCirc Res 2012NontrivialTherapeutic approach In clinical trials Approved therapy Enzyme replacement therapy YESYESGene therapy YESYESNuclear receptor ligands YESYESChromatin or DNA modulators YESYESArtificial transcription factors YESNOMicroRNA modulators YESNOCis-acting lncRNA modulators NONOTrans-acting lncRNA modulators NONOConfidence非タンパクコードRNAを利用した医薬開発Genome NetworkGene 3Gene 4ncRNA 1ncRNA 6Gene 1Protein 1Protein 8DrugProtein 9Protein 7Protein 7Gene 10Protein 2Gene 5Protein 3Protein 11Protein 4Gene 6Gene 9ncRNA 4Protein 13PGene 7Protein 5Protein 5Protein 12DiseaseProtein XncRNA 2Gene 8Gene 2Gene 11ncRNA 3New Target of MedicineProtein 10Mutsumi Kanamori-Katayama Ph.D.Yoshihide Hayashizaki M.D., Ph.D.RIKEN Genome Sciences Center Genome Exploration Research Group物种间数量变化趋势Ryan et.al, BioEssays 29:288–299 (2007 )Non Coding RNA分类LncRNA200nt结构类似mRNA具有外显子/内含子低蛋白编码潜力LncRNA来源Cabili MN. Integrative annotation of human large intergenic noncoding RNAs reveals global properties and specific subclasses. Genes Dev. 2011 Sep 15;25(18):1915-27LncRNA表达特异性lncRNA调控方式案例ncRNA调控lncRNA反式与顺式调控ncRNA PANDA募集转录因子NF-YA,启动细胞凋亡通路lncRNA的反式调控方式Cell 2011ncRNA- and Pc2 Methylation-Dependent Gene Relocation between Nuclear Structures Mediates Gene Activation Programs反式调控Nature Medicine 2010Expression of a noncoding RNA is elevated in Alzheimer’s disease and drives rapid feed-forward regulation of β-secretase expression早发老年性痴呆病中BACE1-AS高表达导致BACE1 mRNA稳定性增高,蛋白积聚,体现了ncRNA的毒性效应BACE1BACE1-ASlncRNA的顺式调控方式——稳定RNA拷贝数染色体定位表达Science案例分析IF:31.027其明成功案例所涉及的实验技术实验材料芯片结果聚类图测序结果散点图back实验结果lncRNA-DC在DC/mono细胞群中的表达情况lncRNA-DC在免疫细胞中的表达情况Northern blotbackChIP-Seq与ChIP-PCR结果back荧光素酶报告分析,验证转录因子结合区域back荧光素酶报告实验干扰结果LNC-DC行驶的细胞功能研究过表达结果back抑制DC细胞分化back小鼠干扰模型通过STAT3的RIP实验验证Lnc-DC与STAT3相互结合backRIP RNA Pull do

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