酶分子一级结构.docVIP

5－1－1－1 酶分子的一级结构 ??? 构成酶蛋白的20种基本氨基酸的种类、数目和排列顺序，是酶蛋白的一级结构。组成酶蛋白的氨基酸的数目和种类与其催化的反应性质及酶的来源有关。例如，猪胃蛋白酶，在酸性很强的胃液中起催化作用，其分子中酸性氨基酸的数目远大于碱性氨基酸（43：4），这是与其催化的环境相适应的。 ??? 来源不同的同一酶或功能相似的酶，氨基酸组成相近。但并不相同。存在生物种间的差异，甚至存在个体、器官、组织间的差异。例如，植物溶菌酶与动物溶菌酶相比，其分子中脯氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸含量非常高。狒狒乳汁溶菌酶与人溶菌酶的一级结构之间，有几个氨基酸残基不同，狒狒溶菌酶含精氨酸少，且不含蛋氨酸。同是鸭卵溶菌酶，Ⅱ型和Ⅲ型酶中，赖氨酸、酪氨酸、甘氨酸数目，也分别相差1～2个。 ??? 在一级结构中，有些酶的－SH参与酶的活性中心，是活性中心最重要基因之一，有些酶的二硫键对维持酶的活性很重要，或通过－S－S－与－SH互变表现酶的活性。 5－1－1－2 酶分子的空间结构 ??? 酶分子的空间结构即是维持酶活性中心所必需的构象。酶和其他蛋白质一样，二级结构单元主要是?－螺旋，?－折叠、?－转角和无规卷曲四种。酶分子的肽链以?－折叠结构为主，折且结构间以?－螺旋及折叠肽链段相连。?－折叠为酶分子提供了坚固的结构基础，以保持酶分子呈球状或椭圆状。 ??? 在酶的二级结构中，结构单元在结合底物过程中，常发生位移或转变。从酶活性中心的柔性特征来看，有人提出?－折叠结构可能对肽链的构象相对位移有利，这种结构可以把一些空间位置上邻近的肽段固定在一起，以维持稳定的活性构象。 ??? 酶分子（或亚基）的三级结构是球状外观。在三级结构构建过程中，?－折叠总是沿主肽链方向于右手扭曲，构成圆筒形或马鞍形的结构骨架，?－螺旋围绕着?－折叠骨架结构的周围或两侧，形成紧密曲折折叠的球状三级结构。由于非极性氨基酸，如苯丙氨酸、亮氨酸、丙氨酸等在?－折叠中出现的几率很大，因此在分子内部形成疏水核心，而表面则多为?－螺旋酸性氨基酸残基的亲水侧链所占据。 ??? 除少数单体酶外，大多数酶是由多个亚基组成的寡聚体。亚基间的空间排布，即是酶的四级结构。亚基间主要依靠疏水作用联结，范德华力、盐键、氢键等也具有一定作用。亚基数目以双亚基和四亚基居多。亚基的排布以对称型较多，主要有循环对称（Cn）和三面体对称（Dn）两种类型，但也有不对称排列。在多数情况下，每个亚基有一个活性部位，也有不少例子说明，一个完整的活性部位，是由一个以上亚基共同组成的。对于多功能酶，全酶由多个亚基组成，不同亚基有不同的功能，其中有的亚基含催化活性部位，但各自催化不同的化学反应。如大肠杆菌DNA聚合酶Ⅲ全酶有?、?、?、?*、?、?、?、?、?和?10个亚基，其中?、?、和?构成核心聚合酶，?亚基含有合成作用活性部位，?亚基的活性部位，则具有3→5外切核酸酶活性，?亚基的功能是促使核心酶形成二聚体。 5－1－1－3 酶分子功能部位的划分 ??? 酶分子球形结构表面，存在着多种功能性区域。酶分子主要生物学功能是催化特异的化学反应，因此与催化有关的功能区域如活性中心自然是酶学研究的重点。但是，酶除具有催化功能外还有其他一些生物功能，亦即分子中存在着其他功能部位，如抑制剂、激活剂、别构效应剂结合部位，亚基间相互识别、相互结合部位，与酶在膜上定位和定向有关的区域，以及酶蛋白中相对独立功能的小区，即酶分子模体等，这些都是与催化功能直接或间接相关的部位。因此，对酶活性中心以外的功能区域的研究，也是酶学研究需重视的内容。 5－1－2 酶的活性中心与必需基团 5－1－2－1 酶活性中心的概念 ??? 对酶结构多年的研究已肯定地认为：在酶分子上，不是全部氨基酸，而只是少数氨基酸残基与酶的活性有直接关系的。这些相关的氨基酸，一般较集中在酶分子的一个特定区域，这个区域即为酶的活性中心（Active center）或活性部位（Active site），是酶蛋白的催化结构域中与底物结合并发挥催化作用的部位。例如，溶菌酶作用的底物，是细菌细胞壁多糖，但酶分子与其接触的部位，只有10个左右的氨基酸残基。就体积而言，活性中心仅占酶分子的1％－2％。活性中心面积也不到酶分子的5％。 ??? 酶分子活性中心的化学基团，可能是某些氨基酸残基的侧链基团或肽链末端氨基或羧基。这些基团一般不集中分布在肽链的某一区域，更不互相毗邻，也就是说在一级结构上相距较远，它们是依靠酶分子肽链的盘曲或折叠，才能使这些基团集中于分子表面某一空间区域，如牛胰核糖核酸酶活性中心主要由肽链上第12位和119位两个组氨酸残基组成，但在空间结构中两个咪唑基之间仅相距约5nm。从某种意义上讲，对于酶活性中心，空间结构远比一级结构更重要，因为只有空间结构才能形成酶的活