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                    B型DNA仅仅是众多DNA双螺旋构象中的一种。在外界条件的改变下,双螺旋的构象也会改变。 模型中的碱基配对有何重要性? ①A-T,G-C配对可形成很好的线性氢键; ②A-T对和G-C对的几何形状一样,使双链距离相近,使双螺旋保持均一; ③碱基对处在同一平面内。不论核苷酸的顺序如何,都不影响双螺旋的结构; ④为DNA半保留复制奠定了基础。                                        第三节DNA的结构和性质  一.DNA二级结构的稳定因素    (1)碱基对之间的氢键。    (2)碱基的堆集力。            它包括:        ① 疏水作用;        ② 范德华力;        ③ 磷酸基的负电荷斥力;  二. 双螺旋结构的构象变异 DNA的构象现已知有 A,B,C,D,E,T,Z 7种。   引起DNA双链构象改变有以下因素: (1)核苷酸顺序; (2)碱基组成; (3)盐的种类; (4)相对湿度。   Z-DNA的发现: 1972年    Pohl  et al 发现 poly(dG-dC)在高盐下旋光性发生改变; 1979年   Wang A.H-J(王惠君),  A.Rich对 d(CGCGCG)单晶作X衍射分析提出Z-DNA模型 三 左旋DNA (一)Z-DNA的结构特点: (1)糖磷骨架呈“之”字形(Zigzag)走向。 (2)左旋。   (3) G的糖苷键呈顺式(Syn) ,使G残基位        于分子表面。 (4)分子外形呈波形。   (5) 大沟消失,小沟窄而深。   (6) 每个螺旋有12bp。  目前已知DNA双螺旋结构可分为A、B、C、D及Z型等数种,除Z型为左手双螺旋外,其余均为右手双螺旋。                   生化专业术语委员会               建议用俯视图(N9→C1’) =0°±90 °  时为顺式(syn) =180°±90 °  时为反式(anti) 嘌呤核苷的扭转角为X(C4,N9,C1’,0);嘧啶核苷的扭转角为X(C2,N1,C1’,0)。  习惯用法是: X= –60 °~0 °~120 °为顺式; X=120 ° ~180 ° ~ –60 °为反式;  核苷的顺反构象 Z-DNA存在的条件:   (1) 高盐:NaCl2Mol/L, MgCl20.7 Mol/L   (2) Pu,Py相间排列: (3)在活细胞中如果m5C,则无需嘌呤-嘧啶相间排列,在生理盐水的浓度下可产生Z型。   (4) 在体内多胺化合物,如精胺和亚胺及亚精胺和阳离子一样,可和磷酸基因结合,使B-DNA转变成 Z-DNA。   (5)某些蛋白质如Z-DNA结合蛋白带有正电荷,可使DNA周围形成局部的高盐浓度和微环境。    (6)负超螺旋的存在  (三)生物学意义 (1) 可能提供某些调节蛋白的识别。啮齿   类动物病毒的复制起始部位有d(GC)有交替顺序的存在; (2)在SV40的增强子中有三段8bp的Z-DNA存在。 (3)原生动物纤毛虫,它有大、小两个核,大核有转录活性,小核和繁殖有关。Z-DNA抗体以萤光标记后,显示仅和大核DNA结合,而不和小核的DNA结合,说明大核DNA有Z-DNA的存在,可能和转录有关。   四、DNA的三级结构 所谓DNA的三级结构,是指在一二结构基础上的多聚核苷酸链上的卷曲。在一定意义上,是指双螺旋基础上的卷曲  三级结构包括链的扭结和超螺旋或者是单链形成的环或是环状DNA中的连环体   超螺旋(Supercoied)  松驰型DNA (relax form)。 超螺旋(Supercoied) DNA,      负超螺旋   正超螺旋  检测DNA三级结构的方法:     密度梯度离心     凝胶电泳     电镜观察  (一)DNA的超螺旋结构 原核生物DNA的三级结构: 绝大多数原核生物的DNA都是共价封闭的环状双螺旋。如果再进一步盘绕则形成麻花状的超螺旋三级结构。  超螺旋的定量描叙 White方程: L=T+W L(Linking nnmber):链环数或称拓扑环绕数,指cccDNA中一条链绕另一条链的总次数。其特点是 (1)   L是整数; (2)  在 cccDNA中任何拓扑学状态中其值        保持不变; (3)  右手螺旋对L取正值。  W(Writhing number):扭曲数,即超数旋数。 其特点是: (1)可以是非整数; (2)是变量; (3)右手螺旋时,W取负值。  T(Twisting number):缠绕数,即双螺旋的圈数。 其特点是:     (1) 可以是非整数;     (2) 是变量;     (3) 右手螺旋时T为正值。  超螺旋的量度可
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