01-蛋白质的结构及功能1.pptVIP

一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础，但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。 二、蛋白质二级结构 定义：蛋白质的二级结构 (secondary structure)是指 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构， 即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置， 并不涉及氨基酸残基侧链的构象 。 主要的结构单位：肽单元 (peptide unit) 主要的化学键：氢键 (hydrogen bond) （一）参与肽键形成的6个原子在同一平面上 参与肽键的6个原子C?1、C、 O、N、H、C?2位于同一平面， C?1和C?2在平面上所处的位置 为反式 (trans)构型， 此同一平面上的6个原子构成了 所谓的肽单元 (peptide unit)。 2 3 ?-螺旋 (?-helix) ?-折叠 (?-pleated sheet) ?-转角 (?-turn) 无规卷曲 (random coil) 常见的蛋白质二级结构 （二）?-螺旋是最常见的二级结构 右手螺旋；氨基酸侧链伸在外侧 （三）?-折叠使多肽链形成片层结构 肽链充分伸展 （四）?-转角和无规卷曲 ?-转角 无规卷曲：没有确定规律性的那部分肽链结构。 （五）模体是具有特殊功能的超二级结构 二级结构组合形式有3种：??，???，??。 两个或两个以上具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个有规则的二级结构组合，称为超二级结构。 钙结合蛋白中结合钙离子的模体 锌指结构 ?-螺旋-?转角/环-?-螺旋模体 链-?转角-链模体 链-?转角-?-螺旋-?转角-链模体 模体常见的形式 模体 (motif)：是具有特殊功能的超二级结构，是由两个 或三个具有二级结构的肽段，在空间上 相互接近，形成一个特殊的空间构象。 （六）侧链对二级结构形成的影响 蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。 一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成?-螺旋或?-折叠，它就会出现相应的二级结构。 肌红蛋白 (Mb) 纤连蛋白分子的结构域 （二）结构域 分子量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密的区域，并各行其功能，称为结构域 (domain)。 1.结构域与分子整体以共价键相连2.具有相对独立的空间构象和生物学功能3.同一蛋白质中的结构域可以相同或不同，不同蛋白质中的结构域也可能相同或不同 （三）分子伴侣 分子伴侣 (chaperon)通过提供一个保护环境从而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。 分子伴侣可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合随后松开，如此重复进行可防止错误的聚集发生，使肽链正确折叠。 分子伴侣也可与错误聚集的肽段结合，使之解聚后，再诱导其正确折叠。 分子伴侣在蛋白质分子折叠过程中二硫键的正确形成起了重要的作用。 亚基之间的结合主要是氢键和离子键。 四、蛋白质的四级结构 蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，称为蛋白质的四级结构 (quaternary structure)。 有些蛋白质分子含有两条或多条多肽链，每一条多肽链都有完整的三级结构，称为蛋白质的亚基 (subunit)。 由2个亚基组成的蛋白质四级结构中，若亚基分子结构相同，称之为同二聚体 (homodimer)，若亚基分子结构不同，则称之为异二聚体 (heterodimer)。 血红蛋白的四级结构 五、蛋白质的分类 根据蛋白质组成成分: 单纯蛋白质 结合蛋白质 = 蛋白质部分 + 非蛋白质部分 根据蛋白质形状: 纤维状蛋白质：长轴/短轴10 球状蛋白质 六、蛋白质组学 （一）蛋白质组学基本概念 蛋白质组是指一种细胞或一种生物所表达的全部蛋白质，即“一种基因组所表达的全套蛋白质”。 （二）蛋白质组学研究技术平台 蛋白质组学是高通量，高效率的研究: 双向电泳分离样品蛋白质 蛋白质点的定位、切取 蛋白质点的质谱分析 （三）蛋白质组学研究的科学意义 蛋白质结构与功能的关系 The Relation of Structure and Function of Protein 第三节 （一）一级结构是空间构象的基础 一、一级结构是基础 牛核糖核酸酶的一级结构 二硫键 （二）一级结构相似的蛋白质具有相似的高级结构与功能 Ala Ile Ser Thr 马 Ala Val Ser Ala 羊 Ala Val Gly Ala 牛 Ser Ile Gly Thr 兔 Ala Ile Ser Thr 狗 Ala Ile Ser Thr 猪 Thr Ile Ser Thr 人 B30 A10 A6 A5 氨基酸残基序号 胰岛