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目 录生物芯片基因芯片及其原理 基因芯片步骤基因芯片应用 生物芯片简介及分类 一、生物芯片(biochip)的概念 指通过自动印迹或光引导化学合成技术在硅片、玻璃、凝胶或尼龙膜上制造的生物分子微阵列，以实现对细胞、蛋白质、基因及其他组分的准确、快速、大信息量的检测。 主要特点：高通量、微型化和自动化。 Microarrays are Popular and usefulPubMed search microarray= 27,926 papers2005 ===== 8342000 = 294二、生物芯片的分类(一)按载体材料分类玻璃芯片、硅芯片、陶瓷芯片。(二)按芯片的使用功能分类测序芯片、表达谱芯片、基因差异表达分析芯片。(三)按芯片固定的生物分子类型分类基因芯片、蛋白质芯片和芯片实验室3. Scan2. Wash Over Array For Example - Gene MicroarraysDifferent GeneSample 1. Label sample 3. Scan2. Wash Over Array For Example - Protein MicroarraysDifferent ProteinsDifferent AntibodiesSample 1. Label sample 基因芯片 基因芯片技术(gene chip): 将大量探针分子固定于支持物上，根据碱基互补配对原理，与标记的样品分子进行杂交，通过检测杂交信号的强度及分布进行基因分析。SouthernBlotDot BlotMacroarrayMicroarray基因芯片发展历史基因芯片流程42153芯片制作、样品制备、分子杂交、信号检测与结果分析基因芯片技术一、芯片制备 1.合成探针 2.载体：玻片、瓷片、硅片；尼龙膜、NC膜 2.探针在载体的固定：原位合成；合成点样原位合成技术(一)原位光刻合成技术光敏保护集团原位合成原理步骤1步骤2步骤3步骤4原位合成技术（二）压电打印法原位合成技术（三）分子印章原位合成合成点样合成探针基因芯片技术二、样品制备基因组DNAPCRFITC CY3基因芯片技术三、杂交反应 四、信号检测Spotted Microarrays – Two ChannelsCoreALL cDNAsAML cDNAsSpot InterpretationGreen Spot – higher expression in ALL.Red Spot – higher expression in AML.Yellow Spot – equal expression in both.Black Spot – not expressed in either.Cy3 DyeLabelCy5 DyeLabelMix and hybridize onto slideCy5Cy3基因芯片技术五、结果分析Cy5Cy3log2Cy3Cy5Experiments842fold248UnderexpressedOverexpressedGenesExample: H1N1 VIRUSNPMeasuring Fluorescence ? 2003 Discovering genomics AM Campbell LJ HeyerNorthern Blot Comparison基因芯片的特点 ①微型化和自动化。现已出现的芯片面积最大不过525cm２,最小仅有1cm２,;每个阵列中阵点样品DNA的用量仅为5nl(0.5μg/μL)左右;同时杂交和洗片等过程都可实现自动化,工作效率大幅度提高。②高度平行性。基因芯片技术是将待研究的基因制作成芯片,并在同一张芯片上同时对实验组和对照组材料进行杂交分析,从而使实验结果具有可比性.③巨大的信息产出率。在一张芯片上不仅可以获得组织、细胞、血液等基因表达信号的定性、定量分析，还可实现全局检测静态到动态、时间与空间上的差异及遗传信息。基因芯片的特点 ④高度敏感性和专一性。能可靠并准确检测出10 pg/μL的DNA样品。 ⑤高度重复性。一张由尼龙膜制作的微阵列，可以重复杂交使用多达20次。⑥强大的类比性。使得以往需多次处理的遗传分析在同一时间和条件下快速完成。⑦哺育新的实验方法。此技术易与其它常规生物技术相融合交叉。基因芯片这些独一无二的特点也代表了后基因组时代技术的发展方向。生物学与医学研究基因表达谱、功能基因组等临床诊断和其他生物检测与其他检测手段的竞争个人基因档案个体化医学、药物开发 基因芯片的应用基因表达分析： 人类基因组编码大约100,000个不同的基因，基因芯片技术