胃癌中miRNA的表达标记.doc

胃癌中miRNAs的表达标记 罗红春1，张祯祯2，张霞3，宁波3，郭进军3，聂娜1，刘波1，吴小翎3 （1重庆医科大学检验实验室，重庆，400016；2重庆医科大学省部共建感染性疾病分子生物学教育部重点实验室，重庆医科大学病毒性肝炎研究所，重庆，400016；3重庆医科大学第二附属医院消化内科，重庆，400010） 摘要 目的：为了鉴别胃癌中miRNAs 的表达标记，建立一种新的诊断和预测胃癌的方法。方法：运用基因芯片技术检测3个正常胃组织标本，24个胃癌组织标本，胃癌细胞SGC7901和正常胃粘膜细胞GES-1中328个miRNAs的表达情况；通过树枝状图谱软件平台分析所有标本的miRNAs的表达谱。用以上方法检测出在胃癌组织和SGC7901中，miR-433 和miR-9的表达水平相对正常胃组织和GES-1显著下调。为了确保结果的准确性，我们采用实时荧光定量PCR对miR-433 和miR-9的表达水平进行验证。结果：我们发现共有26个miRNAs在正常标本（包括3个正常胃组织和GES-1）和胃癌标本(包括24个胃癌组织和SGC7901)中差异表达。胃癌标本相对正常标本，有19个miRNAs下调，7个miRNAs上调。树枝状图谱分析软件根据不同的miRNAs的表达情况，将其明显地划分为胃癌组和正常组，并且在胃癌组中进一步划分出胃癌的不同组织类型。实时荧光定量PCR检测出miR-433 和miR-9在胃癌标本中的表达水平显著下调，该结果和基因芯片检测结果一致。结论：miR-433 和miR-9可能是胃癌中的标记性miRNAs,其在正常标本和胃癌标本中的差异表达可以作为一种新的诊断胃癌的方法。 关键词：miRNA；Real-time PCR；胃癌；基因芯片 中图分类号： R73.3 文献标识码：A MicroRNA Expression Signature in Gastric Cancer LUO Hong-chun1,ZHANG Zhen-zhen2,ZHANG Xia3,NING Bo3,GUO Jin-jun3,NIE Na1,LIU Bo1,WU Xiao-ling3 （1Department of Laboratory Medicine, Chongqing Medical University, Chongqing 400016, 2The Key Laboratory of Molecular Biology of Infectious Diseases of Ministry of Education,The Institute for Viral Hepatitis，Chongqing University of Medical SciencDepartment of Gastroenterolog, The Second Affiliated Hospital of Chongqing University of Medical Science,Chongqing 400010） Abstract Objective: To identify the miRNA specific signature of gastric cancer, construct a novel diagnostic and prognostic tool for gastric cancer. Method: we detected 328 miRNAs expression profiling of 3 normal gastric tissues ,24 malignant tissues, gastric cancer cell SGC7901 and normal gastric cell GES-1 using microarray technology. Then, used the hierarchical clustering algorithm of the Cluster software to analyse the miRNAs expression of all samples. The expression levels of miR-433 and miR-9 which were significant down-regulation in gastric cancer tissues and SGC7901 by microarray technology were validated by quantitative Real-time PCR(qRT-PCR).Results: Differential expres