山西省非综合征型耳聋患者耳聋基因的检测研究-study on detection of deafness genes in patients with non-syndromic deafness in shanxi province.docxVIP
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山西省非综合征型耳聋患者耳聋基因的检测研究-study on detection of deafness genes in patients with non-syndromic deafness in shanxi province
2.1测序结果..........................................................................................................................282.2电泳结果..........................................................................................................................283讨论......................................................................................................................................304结论......................................................................................................................................31参考文献.........................................................................................................................................32综述.............................................................................................................................................34致谢.............................................................................................................................................44在学期间承担/参与的科研课题与研究成果.....................................................................45个人简历.........................................................................................................................................46山西省非综合征型耳聋患者耳聋基因的检测分析摘要目的:本课题采用多种检测技术对非综合征性耳聋患者的致病基因进行筛查,统计常见基因的突变位点,寻找新的致病基因,为疾病的产前诊断、早期筛查及治疗提供依据;同时也为耳聋基因的诊断提供了更快速、简便、灵敏的方法。方法:由山西省太原市中心医院中心实验室收集山西省各地区聋哑学校的耳聋患者标本300例,年龄均在8-23岁之间。纳入标准为:除听力下降以外不伴有其他任何临床症状。通过对患者临床症状,检验结果及相关检查确诊并建立资料库。由患者本人或监护人签署知情同意书后采集外周血。采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法对4个常见基因二十个位点进行筛查,并统计突变位点,对未发生突变的标本选取10例用基因捕获+二代测序的方法进行检测,筛选出新的热点致病基因,并合成相应的引物,用Sanger测序的方法对剩余标本进行检测,寻找致病突变位点,用100例正常标本作为对照。结果:1.通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法对300例耳聋患者标本检测后,有152例发生突变。2.在剩余的148例标本中选取10例,经过基因捕获+二代测序的方法进行检测后,有3例发生TRIOBP基因的突变,2例发生TPRN基因的突变。3.通过对上述两个基因的相应外显子进行引物的设计与合成,对剩余的138例标本用Sanger测序进行检测,发现TRIOBP基因中,131例携带c.3559TC(p.F1187L),11例携带c.3070CA(p.P1024T)的突变,通过正常对照的验证,c.3559TCT可能是SNP位点,而c.3070CA在正常对照组中未被发现,该位点能否导致I耳聋,还有待进一步验证;TPRN基因未见突变。结论:1.GJB2、SLC26A4、GJB3、线粒体DNA这四个基因是山西省耳聋患者的主要致病基因,但各突变位点的携带率与全国其他地区有明显的差异;2.TRIO
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