上海市2010~2014年志贺氏菌流行特征及喹诺酮类耐药基因研究-epidemic characteristics and quinolone resistance genes of shigella in shanghai from 2010 to 2014.docxVIP

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2018-07-31 发布于上海
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上海市2010~2014年志贺氏菌流行特征及喹诺酮类耐药基因研究-epidemic characteristics and quinolone resistance genes of shigella in shanghai from 2010 to 2014

糖苷乙酰转移酶变异基因（aac(6’)-Ib-cr）进行筛选。扩增产物进行DNA测序。结果gyrA和parC基因的突变率分别为98.6%和97.8%。gyrA基因存在Ser83、Asp87和His211这三个位点的突变，ParC基因只检测到Ser80这一个位点的突变。所有环丙沙星敏感的菌株均未出现gryA基因的Asp87这一位点的突变。共检测到9株qnrS和6株aac(6’)-Ib-cr喹诺酮耐药质粒。可见，上海地区福氏志贺菌在QRDR区氨基酸的突变率极高。Asp87这个位点的突变对喹诺酮类抗生素的耐药起着主导作用。采用国际食源性监测网络PulseNet推荐的PFGE标准方法对其进行基因分型,用BioNumerics软件分析电泳图谱。139株福氏志贺菌共有97个带型，分成7个聚类，其中128株菌株为同一聚类，占92.9%，其相似度≥80.6%。243株宋内志贺菌共有138个型别，分成17个聚类，其中198株菌株为同一聚类，占81.5%，其相似度≥89.3%。可见，上海地区近几年所流行的志贺菌菌株进化来源于多个克隆，然而亲缘关系较近。根据warwick网站(http://mlst.warwick.ac.uk/mlst/)数据库提供的7个管家基因位点进行PCR扩增，对各管家基因PCR产物进行碱基序列测定，与warwick数据库中序列进行对比，得到各菌株相应的序列型（sequencetype,ST）。共检测到3种ST型，分别为ST245，ST145和ST628,除了4株福氏6型志贺菌属于ST145和1株福氏3a属于ST628，其他菌株都是ST245型，占96.4%。可见上海地区福氏志贺菌亲缘关系近，绝大多数的菌株的流行是以ST245型为主的克隆。关键词：志贺菌，药敏试验，毒力检测，喹诺酮类，基因型IIIRESEARCHONEPIDEMICCHARACTERRISTICSANDANTIBIOTICRESISTANCEGENEAGAINSTQUINOLONEOFSHIGELLAAMONGHUMANSINSHANGHAICHINAFROM2010TO2014ABSTRACTShigellosisisoneofthemostcommondiarrhealdiseasesinhumansworldwide.Approximately125millioncasesofShigellainfectionsoccurannuallyinAsia,ofwhich14,000arefatal.InChina,shigellosisisoneofthetopfournotifiableinfectiousdiseases,with1.7millionepisodesofbacillarydysentery,and200,000patientsadmittedtohospitalseachyear.BasedonthestructureofOantigen,Shigellaincludes49serotypesandsubserotype,whichcanbedividedintofourspecies:Shigellaboydii,Shigella.dysenteriae,Shigellaflexneri,andShigellasonni.Amongthem,S.sonneiisthemostprevalentspeciesindevelopedcountries,whilstS.flexneriismostreportedindevelopingcountries.However,thedistributionofShigellaspp.ischanginginrecentyears.S.sonneihasbecomedominantinsomeAsiancountries.Shigellosisisoftentreatedwithantibioticstoreduceexcretionandtoshortenthedurationofillness.However,theprogressiveincreaseinantimicrobialresistance,especiallymultidrugresistanceamongShigelladuetotheantimicrobialoveruse,isbecomingacriticalpublichealthproblem.BecauseincreasedmobilityofthepopulationappreciatesthepropagationofShigellaspp.,distributionanddrugresistanceofShigellaspp.havechangedlargely