46份大白菜种质资源SSR标记遗传多样性分析.docVIP

46份大白菜种质资源SSR标记遗传多样性分析 　　摘 要：利用30对SSR引物分析了46 份大白菜品种的遗传多样性。结果表明，30对引物共检测到170个多态性位点，平均每对引物检测到5.667个，变化范围为2～10个；引物的多态信息含量分布范围为0.367～0.793，平均值为0.633，等位基因多样性指数分布范围为0.485～0.817，平均值为0.685。UPGMA 聚类分析将 46 份大白菜品种划分为五大类，说明本研究中的大白菜品种具有较为丰富的遗传多样性。 　　关键词：大白菜；遗传多样性；SSR；聚类分析 　　中图分类号：S634.103.6文献标识号：A文章编号：1001-4942（2016）05-0005-04 　　Abstract Thirty primers of SSR molecular markers were used to analyze the genetic diversities of 46 Chinese cabbage varieties. The results showed that a total of 170 alleles were identified with an average of 5.667 alleles per locus， which varied from 2 to 10. The polymorphism information content （PIC） varied widely from 0.367 to 0.793 with an average value of 0.633. And the allelic diversity index varied from 0.485 to 0.817 with an average value of 0.685. Cluster analysis with UPGMA showed that the 46 Chinese cabbage varieties could be classified into five groups， which reflected that they owned abundant genetic diversities. 　　Key words Chinese cabbage； Genetic diversity； SSR； Cluster analysis 　　大白菜Brassica campestris L. ssp. pekinensis （Lour） Olsson是世界范围内的主要蔬菜品种之一，原产于我国，在我国蔬菜栽培面积中占第一位，栽培历史悠久，品种丰富。随着大白菜品种的日益增多，研究大白菜品种间的遗传多样性有利于种质创新、品种鉴定和育种工作的开展。 　　分子标记是继形态、细胞和生化标记之后发展非常迅速的遗传标记技术，以DNA形式表现，具有不易受环境影响、多态性高和易检测等优点。分子标记在品种遗传多样性研究中是一种有效的技术手段，目前，应用在遗传多样性分析中的分子标记主要有AFLP、ISSR和SSR等，其中SSR标记以其丰富的多态性被广泛应用于蔬菜作物。SSR 标记又称为简单重复序列，具有共显性、高度重复性、多态性好、稳定可靠以及经济方便等优点，已广泛应用于作物遗传多样性研究，例如大麦[1，2]、大豆[3]、水稻[4]、小麦[5]等中。杨华等[6]利用SSR标记对61份芸薹属蔬菜进行遗传多样性分析，将材料分为甘蓝和白菜两大类。黄宝勇等[7]对11个大白菜用 RAPD 进行亲缘关系分析，当遗传距离为0.18 时，11 份材料分为两类生态群，一类群为直筒类型，另一类群在遗传距离为0.15时，又可分为矮桩型、直筒与矮桩的过渡型两个类群，说明大白菜生态多样性丰富。郭晶心等[8]采用 AFLP 对 137份白菜类群体的聚类分析表明，大白菜和薹菜亲缘关系密切，芜菁和白菜类亲缘关系较远，小白菜的起源较大白菜早，而大白菜的遗传多样性较为狭窄。 　　本研究利用30对SSR引物对近十几年进行新品种保护的大白菜品种进行遗传多样性分析，旨在从分子水平上明确大白菜品种资源的遗传多样性，为大白菜品种育种、种质创新和品种鉴定提供理论依据。 　　1 材料与方法 　　1.1 试验材料 　　试验材料为46 份大白菜种质资源（表1），分别来自北京、杭州、济南、莱州、临朐、青岛、上海、沈阳、天津、潍坊、新乡、杨凌。其中13份为收集的已知品种，33份为近几年申请新品种权的品种。 　　1.2 基因组DNA 提取 　　采用Weising等[9]的CTAB法提取白菜基因组DNA。取幼嫩叶片0.2 g放入1.5 mL离心管中，在液氮中研碎；将DNA提取液预热到65℃，每管加入400 μL