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R软件在Logistic回归模型中应用
R软件在Logistic回归模型中应用
摘要:本文主要通过R软件对定性数据分析中的Logistic回归模型进行模型建立及预测拟合。
关键词:Logistic回归模型;R软件:预测拟合
中图分类号:TP311 文献标识码:A 文章编号:1009-3044(2018)15-0269-02
logistic回归又称logistic回归分析,主要在流行病学中应用较多,比较常用的情形是探索某疾病的危险因素,建立起该疾病发生概率与危险因素之间的函数关系,从而根据危险因素预测某疾病发生的概率等等。例如欲探讨心血管病发生的危险因素,可以先找几个可能的影响因素逐一进行分析,也就是一元的Logistic回归,也可以几个因素一起分析,就要建立多元Logistic回归模型。
R软件是统计领域广泛使用的,随着云时代的来临,大数据技术的发展,对于数据分析,数据挖掘以及数据可视化等的应用,R软件由于其免费、自由、开源以及有众多包的支持,R程序可以简洁明了的解决很多问题,因此R软件的应用越来越广泛,也被越来越多的人接受和使用。本文主要通过使用R软件对一元Logistic回归模型的问题进行求解和说明。
1 Logistic回归模型
一般有以下形式的数学函数:[π(x)=exp(α+βx)1+exp(α+βx)]称作logistic回归函数。
把以上函数线性化可以得到:[lnπ(x)1-π(x)=α+βx]
我们这里讨论的[π(x)]是患某种疾病的概率,记为p,人们通常把p的某个函数f(p)假设为变量的函数形式,取[f(p)=lnπ(x)1-π(x)=lnp1-p],称之为logit函数,也叫逻辑斯蒂变换。最重要的逻辑斯蒂回归模型是logistic线性回归模型,多元logit模型的形式为:[lnp1-p=β0+β1x1+…+βkxk],其中[β0,β1,…,βk] 是待估参数。最简单的logit线性模型为:[lnp1-p=α+βx],此时的概率应为:[p=eα+βx1+eα+βx]
2 Logistic回归模型在R软件中的实现
例1体质指数BMI大于等于25为肥胖,某高校3983位体检职工中有388位肥胖者,肥胖者患心血管病的体检数据见表1:
问可否建立患心血管病的概率p与体质指数BMI(设为x)间的函数关系 [p=π(x)]?
我们可以先做列联表的独立性检验,即检验体质指数与是否患心血管病是否相互独立,检验的R程序如下:
library(vcd)
x-c(68,55,66,32,21,25,42,38,20,10,7,4)
dim(x)-c(6,2)
assocstats(x)
程序运行结果如下:
X^2 df P( X^2)
Likelihood Ratio 15.330 50.0090411
Pearson 14.737 5 0.0115481
Phi-Coefficient : NA
Contingency Coeff.: 0.191
Cramers V : 0.195
结果的p值小于0.05,因此认为体质指数与是否患心血管病是不相互独立的,也即体质指数与是否患心血管病是有关联的。
接下来做logit模型及预测,R程序如下:
x-rep(c(25,26,27,28,29,30,25,26,27,28,29,30),c(68,55,66,32,21,25,42,38,20,10,7,4))
y-rep(c(1,0),c(267,121))
Discount-data.frame(x,y)
log.glm-glm(y~x,family=binomial,data=Discount)
summary(log.glm)
#预测拟合
pre-predict(log.glm,data.frame(x=25:30))
p-exp(pre)/(1+exp(pre));p
回归结果如下:
Call:
glm(formula = y ~ x, family = binomial, data = Discount)
Deviance Residuals:
Min 1Q Median 3Q Max
-1.9229 -1.3480 0.7373 0.9167 1.0159
Coefficients:
Estimate Std. Error z value Pr(|z|)
(Intercept) -6.03235 2.08929 -2.887 0.00389 **
x 0.25700 0.07893 3.256 0.00
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