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  • 2018-08-15 发布于福建
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中药材景天三七DNA提取方法比较分析.doc

中药材景天三七DNA提取方法比较分析

中药材景天三七DNA提取方法的比较分析   摘要:以景天三七药材为材料,分别采用改良CTAB法、SDS法、高盐低pH法对其DNA进行提取并检测,旨在建立一种适合中药材景天三七的DNA提取方法。结果表明,改良CTAB法提取的DNA浓度为290 μg/mL,电泳条带最亮,无拖尾现象,在浓度和纯度方面均优于其他2种方法,并可用于ISSR-CR扩增,改良CTAB法是中药材景天三七DNA提取的最佳方法。   关键词:中药材;景天三七;DNA提取;改良CTAB法;SDS法;高盐低pH法   中图分类号: S5672360文献标志码: A   文章编号:002-302(204)2-0047-03   目前,分子生物学技术在中药材研究中广泛应用,如药用植物的亲缘与进化关系、种质鉴定、分类和提取[-3]等,而DNA的分离纯化是中药材分子生物学研究的基础。但商品药材经过干燥、加工、贮藏等过程,DNA会出现不同程度的降解;同时,由于中药材中的小分子次生物质,如有机酸、萜类、香豆素、鞣质、黄酮等含酚羟基化合物,氧化后容易与DNA结合,[2]引起DNA降解,而其中存在的多糖由于与DNA同属于大分子化合物,在一般提取过程中很难完全去除,因此,针对不同药材进行DNA 提取方法的探索是有必要的。所以,本研究以市售景天三七(Sedum aizoon L)干品药材和新鲜嫩叶为材料,采用改良CTAB法、SDS法、高盐低pH法提取干品景天三七DNA,并对3种提取结果进行比较分析,选出适合中药材景天三七的简便、快速、高纯度的DNA提取方法,为中药材景天三七的遗传多样性、种质鉴定等分子水平的研究提供依据。   材料与方法   材料   中药材景天三七购自同仁堂药店,嫩叶取自运城学院栽种的中药材景天三七。   2试剂   CTAB、SDS、V、NaCl、Tris-HCl(pH值80)、EDTA、KAc、Tris饱和酚、β-巯基乙醇、异戊醇、异丙醇购自北京拜尔迪生物技术有限公司,RNase、rimer UBC89、 Taq聚合酶等试剂均购自上海生工生物工程技术有限公司。   3DNA提取方法   3改良CTAB法   材料加入液氮充分研磨后转入离心管,加入65 ℃预热的CTAB缓冲液,2 μL β-巯基乙醇,充分混匀;65 ℃温浴30~45 min,2 000 r/min 4 ℃离心0 min;上清液加入等体积酚 ∶[KG-3]三氯甲烷 ∶[KG-3]异戊醇(25 ∶[KG-3]24 ∶[KG-3])充分混匀,2 000 r/min 4 ℃离心0 min;取上清液,重复以上步骤 ~2次,直到界面清晰为止;上清液加入等体积的三氯甲烷 ∶[KG-3]异戊醇(24 ∶[KG-3])充分混匀,2 000 r/min 4 ℃离心0 min;上清液加入2~3倍体积的-20 ℃预冷无水乙醇,于-20 ℃静置30 min,沉淀用70%乙醇洗2次后加入50 μL TE溶解,加入RNase于37 ℃温浴 h,4 ℃保存。   32SDS法   材料加入液氮充分研磨后转入离心管,加入65 ℃预热的SDS缓冲液,2 μL β-疏基乙醇,充分混匀,65 ℃温浴30~45 min;取出冷却至室温后加入500 μL 5 mol/L KAc,充分混匀,冰浴20 min,2 000 r/min离心0 min;上清液加入等体积的三氯甲烷 ∶[KG-3]异戊醇(24 ∶[KG-3]),混匀,2 000 r/min 离心0 min;重复抽提次,上清液加入2/3体积的-20 ℃预冷的异丙醇,混匀,-20 ℃沉降30 min,2 000 r/min 离心0 min;上清液加入200 μL的70%乙醇和无水乙醇各洗涤沉淀2次,沉淀晾干后加入30 μL TE溶解,加入RNase于37 ℃水浴锅中恒温45 min,4 ℃保存备用。   33高盐低pH法   材料加入液氮充分研磨后转入离心管,加入56 ℃预热的2% SDS缓冲液,2 μL β-巯基乙醇,充分混匀,56 ℃温浴30 min,2 000 r/min 4 ℃离心0 min;上清液加入等体积的三氯甲烷:异戊醇(24 ∶[KG-3]),充分混匀,2 000 r/min 4 ℃离心0 min;上清液加入倍体积的异丙醇,2 000 r/min 离心5 min;沉淀的DNA用70%乙醇洗2次,晾干后加入50 μL TE,加入RNase于37 ℃温浴 h,4 ℃保存。   4DNA质量检验   4紫外检测   将所得 DNA提取液稀释00倍后,用UV02紫外分光光度计分别测定230 nm、260 nm及280 nm处的吸光度。根据D260 nm/D280 nm值判断DNA纯度,以D260 nm的值计算DNA浓度。   42琼脂糖凝胶

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