青藏高原栽培青稞SSR标记遗传多样性研究bXe4O.doc

青藏高原栽培青稞SSR标记遗传多样性研究 第46卷第2期中山大学(自然科学版) 2007年3月ACTASCIENTIARUMNATURALIUMUNIVERSITATISSUNYATSENI Vo1.46No.2 Mar.2007 青藏高原栽培青稞SSR标记遗传多样性研究 潘志芬,邹弈星,邓光兵,翟旭光,吴芳,余懋群 (1.中国科学院成都生物所,四川成都610041; 2.中国科学院研究生院,北京100039) 摘要:利用SSR标记评估了64份青藏高原栽培青稞的遗传多样性.选择的30个SSR标记中,22个标记扩增 良好且具有多态性,每位点检测出的等位基因数为2～15个,共检测出等位基因132个,平均6.0个;各多态位 点检测出基因型为2～l1种,多态信息指数为0.16～0.91,平均为0.65.这些表明青藏高原栽培青稞具有丰富 的遗传多样性.同时发现,青藏高原栽培青稞在麦芽性状,淀粉性状,病虫及裸粒等重要农艺性状存在丰富的 变异,是遗传育种的宝贵资源库.不同来源的群体材料的遗传多样性不同,具有区域特异稀有基因.聚类分析 将材料分为四组,材料聚类与材料来源地和生长习性无相关性.聚类图显示了不同材料间的遗传距离或遗传相 似程度,可为材料选择提供参考. 关键词:青藏高原;栽培青稞;SSR标记;遗传多样性 中图分类号:Q75文献标识码:A文章编号:0529—6579(2007)02-0082..05 青稞是我国藏族人民对裸大麦的称谓,它对藏 民的生活有重要影响.青稞不仅是藏民的主要食 粮,燃料和牲畜饲料,也是生产啤酒和保健品的原 料,为藏区人民的健康和经济发展做出了不可低估 的贡献¨J.近年来,由于人们发现青稞比皮大麦 具有更丰富的膳食纤维,更高含量的保健组分和饲 料利用价值,因此青稞育种和利用受到了越来越多 的关注J.我国的青藏高原是世界上青稞资源最 丰富,种植面积最广的地区,但对其遗传多 样性评价和利用都很薄弱,因此,加强现有青稞资 源的研究将有利于青稞资源的保护和大力促进优质 高抗青稞品种的选育和利用. SSR标记具有基因组分布广泛,数量丰富,多 态性高,容易检测,共显性,结果稳定可靠等许多 优点,被认为是用于遗传多样性,品种鉴定,物种 的系统发育,亲缘关系及起源等研究非常有效的分 子标记.目前,SSR标记已用于大豆,水 稻J,玉米等多种植物的遗传研究或辅助育种. SaghaiMaroof等首先进行了大麦SSR标记的 研究,随后许多研究者进行了大麦SSR标记的发 展和相关研究.现已发展的大麦SSR标记约700 个,已作图的微卫星标记约300个,已发现近100 个SSR标记与重要农艺性状联系紧密j.利用 SSR标记进行大麦遗传多样性研究和种质筛选与鉴 定的工作在世界许多地方都已开展,包括德国, 澳大利亚J,中国…J,近东地区¨.关于中国大 麦SSR标记遗传多样性研究的文献很有限,还未 见关于栽培大麦SSR标记遗传多样性的研究报道. 本研究试图通过分析我国青藏高原部分栽培青稞 SSR标记遗传多样性,以期为具有某些优异特性的 青稞品种或资源筛选,青稞资源的保护和建立辅助 我国大麦品种改良的高效SSR分子标记奠定基础, 为重要或稀有基因资源的挖掘提供参考. 1材料和方法 1.1材料 64份栽培六棱青稞,包括45份西藏青稞及19 份四川青稞.按生长习性,64份材料中含51份春 性青稞和13份冬性青稞,冬性青稞全来自西藏. 西藏青稞由西藏农牧科学院农科所强小林研究员提 供,四川青稞材料分别由阿坝州和甘孜州青稞研究 所提供.材料收集地的海拔高度为1600～4200m (表1).中国春为对照. 1.2方法 1.2.1DNA提取DNA提取采用SDS微量提取 法㈦ 收稿日期:2006—07—14 基金项目:国家863计划资助项目(2003AA207100);中国科学院西部之光人才培养资助项目;科技部基础性工作 专项(2006FYI10700) 作者简介:潘志芬(1971年生),女,博士,助理研究员;通讯联系人:余懋群;E-mail:Yumq@cib.ac.cn 第2期潘志芬等:青藏高原栽培青稞SSR标记遗传多样性研究83 表164份青藏高原栽培青稞 Tab.1Listof64cultivatedhullesscultivarsfrom Qinghai—TibetPlateauusedinthisstudy 1.2.2SSR分析 (1)SSR引物选择 根据多态性高,与重要性状相连及每条染色体 均有覆盖的原则选择了已作图定位的SSR标记30 个.1H,2H,3H,4H,5H,6H,7H染色体上分 别选择了2,5,3,7,4,1,7个,其中有5个标 记未与性状建立联系,其余25个分别与大麦品质 性状,抗病性状,抗逆性状及生理性状相关,标记 位点与这些性