11微生物分类鉴定幻灯片.pptVIP

二、微生物的命名 双名法，由二个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成， 一般用斜体表示 属名在前，一般用拉丁字名词表示，字首字母大写 种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写 若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp来表示， 例如 Bacillus sp 二、微生物的命名 由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱， 细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念” 种和亚种指定模式菌株（type strain）； 亚属和属指定模式种（type species）； 属以上至目级分类单元指定模式属（type genus）； 模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。 第三节、细菌分类鉴定的特征和技术 在现代微生物分类中，任何能稳定地反映微生物种类特征的资料， 都有分类学意义，都可以作为分类鉴定的依据。 形态学特征、 生理学特征、 生态学特征 从不同层次(细胞的、分子的)，用不同学科(化学、物理学、 遗传学、免疫学、分子生物学等)的技术方法来研究和比较 不同微生物的细胞、细胞组分或代谢产物，从中发现的反 映微生物类群特征的资料。 生物分类的传统指标： 一、形态学特征 培养特征、 运动性、 特殊的细胞结构、 细胞形态及其染色特性、 等等 微生物分类和鉴定的重要依据之一： a）易于观察和比较，尤其是真核微生物和具有特殊 形态结构的细菌； b）许多形态学特征依赖于多基因的表达，具有相对 的稳定性； 二、生理生化特征 与微生物的酶和调节蛋白质的本质和活性直接相关； 代谢产物等 营养类型； 与氧的关系； 对温度的适应性； 对pH的适应性； 对渗透压的适应性； 酶及蛋白质都是基因产物； 对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较； 测定生理生化特征比直接分析基因组要容易得多； 三、核酸的碱基组成和分子杂交 特点： 与形态及生理生化特性的比较不同，对DNA的碱基 组成的比较和进行核酸分子杂交是直接比较不同微 生物之间基因组的差异，因此结果更加可信。 1. DNA的碱基组成(G+Cmol%) DNA碱基因组成是各种生物一个稳定的特征，即使个别 基因突变，碱基组成也不会发生明显变化。 分类学上，用G+C占全部碱基的克分子百分数(G+Cmol%) 来表示各类生物的DNA碱基因组成特征。 * * 第十一章 微生物的进化、系统发育和分类鉴定 地球上开始出现生命，主要是些类似简单杆状 细菌的原始生物。 大约46亿年前，地球形成； 大约35亿年前，通过“前生命的化学进化”过程 漫长的进化历程 千姿百态的生物种类 进化(evolution)：生物与其生存环境相互作用过程中， 其遗传系统随时间发生一系列不可逆的改变，在大多 数情况下，导致生物表型改变和对生存环境的相对适应。 今天仍生存在地球上的生物种类， 彼此之间都有或远或近的历史渊源。 最原始的生命 漫长的进化历程 千姿百态的生物种类 系统发育(phylogeny)：各类生物进化的历史。 分类(classification)：根据生物特性的特征的相似程度 将其分群归类。 地球上的物种估计大约有150万，其中微生物超过10万种， 而且其数目还在不断增加。 生物分类的二种基本原则： a）根据表型(phenetic)特征的相似程度分群归类，这种 表型分类重在应用，不涉及生物进化或不以反映生 物亲缘关系为目标； b）按照生物系统发育相关性水平来分群归类，其目标 是探寻各种生物之间的进化关系，建立反映生物系 统发育的分类系统。 从进化论诞生以来，已经成生物学家普遍接受的分类原则 生物系统学(systematics) 第一节 进化的测量指征 70年代以前，生物类群间的亲缘关系判断的主要根据： 形态结构、 生理生化、 行为习性，等等 少量的化石资料 表型特征： 一、进化指征的选择 原核生物的特点： 形体微小、 结构简单、 缺少有性繁殖过程， 化石资料凤毛麟角 b）形态特征在不同类群中进化速度差异很大，仅 根据形态推断进化关系往往不准确； 根据形态学特征推断微生物之间的亲缘关系的缺点： a）由于微生物可利用的形态特征少，很难把所有 生物放在同一水平上进行比较； 虽然根据少量表型特征来推测各类微生物的亲缘 关系而提出的许多分类系统，都随着时间的推移 而不断地被否定了。 六、七十年代： 分析和比较生物大分子的结构特征，特别是 蛋白质、RNA和DNA这些反映生物基因组特征 的分子序列，作为判断各类微生物乃至所有 生物进化关系的主要指征。