黄廉其中华肿瘤杂志期刊要点.docx

蛋白质的最新研究 黄廉其1107511114 摘要 随着人类进入后基因组时代，以蛋白质组为研究对象的蛋白质组学越来越受到关注并且得到了迅速的发展。蛋白质是细胞的重要组成部分，是生命活动的执行者。蛋白质在细胞中有着十分重要的功能，包括组成器官、催化生化反应、接受与传递细胞信号、维护细胞环境等。然而，蛋白质的功能注释目前仍不完整，尤其对于高等生物有相当一部分蛋白质的功能是不明确的。用传统的实验方法去确定蛋白质的功能周期长、代价高昂，而且无法从蛋白质组这一整体层面去考虑。新兴的高通量技术产生了海量的蛋白质组学数据，使得用计算的方法来研究蛋白质的功能成为可能。本文基于数据挖掘技术，利用了高通量技术产生的大量蛋白质表达质谱数据、蛋白质氨基酸序列、蛋白质相互作用等蛋白质组学数据，针对蛋白质的功能预测这一问题进行了深入研究。 关键词:数据挖掘;蛋白质功能;亚细胞定位;谷肌甘肤化;磷酸化 ABSTRACT With the coming of the post-genomic era, the proteomics that focuses on investigating proteins function has attracted a lot of attention in life science. Proteins play a critical role in life and are responsible for some very important functions, such as organs constitution, the catalysis of biochemical reactions, the reception and transmission of cell signaling, the maintenance of cell environment, etc. However, the function of many proteins is unknown. For example, about half of the proteins remain uncharacterized for human being. It is expensive and time-consuming to characterize proteins function with traditional experimental techniques in lab. Computational biology provides an alternative way to predicting protein function using high-throughput proteomics data. In our study, we utilize data mining to predict protein function based on protein primary structures, protein-protein interactions and protein expression data. etc. Keywords: data mining; protein function; protein subcellular localizations; S-Glutathionylation; Phosphorylation. 1蛋白质组学 随着人类基因组计划的完成，生命科学进入了后基因组时代，生物学家的工作重心从揭示生命的所有遗传信息转移到遗传信息的功能的研究。但是基因仅是遗传信息的载体，生物功能的主要体现者是基因的表达产物一蛋白质。蛋白质是构成细胞的一种大分子物质，是细胞的重要组成部分，承担了生化反应的催化、细胞信号接收与传递、免疫保护、营养存储、物质运载和储存、机械支持、细胞环境维护等重要功能。蛋白质有其自身特有的活动规律，例如蛋白质的修饰加工、转运定位、结构变化、蛋白质与蛋白质的相互作用、蛋白质与其他生物分子的相互作用等，这些仅从基因的角度来研究是不够的[1，2]。在这种情况下，一个新兴学科蛋白质组学应运而生。蛋白质组学是在后基因组时代出现的一个新的研究领域，它是对机体、组织或细胞的全部蛋白质的表达和功能模式进行研究。 M. R. Wilkins和K.L. Williams最早在1994年提出了蛋白质组学。他们认为蛋白质组学是一个多层面、跨学科的领域，它研究生物系统中蛋白质的复杂性和动态性。它将最新的信息跟强大的分离分析技术结合，来研究生物体和细胞中的蛋白质的功能[3]。 蛋白质组学的研究[4,5]对象已经涵盖了原核生物、真核生物、动物