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不同分子亚型乳腺癌细胞株的拉曼光谱研究-肿瘤学专业论文
目 录
中文摘要………………………………………………………………1 英文摘要………………………………………………………………2 前言……………………………………………………………………4 材料和方法…………………………………...……………………….7 结果…………………………..……………………………………… 11
讨论……………………………………………..…………………… 17
结论………………………………………………..………………… 22
参考文献……………………………………………..……………… 23 综述……………………………………….………………………..26 综述参考文献………………………………………………………...31 致谢……………………………………………….…………………..33
福建医科大学硕士学位论文
福建医科大学硕士学位论文
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不同分子亚型乳腺癌细胞株的拉曼光谱研究
中文摘要
目的 应用显微共聚焦拉曼光谱技术研究不同分子亚型乳腺癌细胞株的拉曼光 谱特征,并探究拉曼光谱技术用于鉴别乳腺癌分子分型的应用价值。
方法 分别培养三种不同分子亚型的人乳腺癌细胞株:Luminal A 型细胞株
MCF-7(ER+/PR+/HER-2-),HER-2 过表达型细胞株 SKBR3(ER-/PR-/HER-2+)
和三阴性型细胞株 MDA-MB-231(ER-/PR-/HER-2-)。每种乳腺癌分子分型细胞 株分别选取 31 个生长状态良好的细胞进行显微共聚焦拉曼光谱检测。将测得的 光谱进行主成分分析(Principle Components Analysis,PCA)和线性判别分析
(Linear Discriminant Analysis,LDA),获得三株细胞株拉曼光谱的典型判别函 数散点图。在 PCA-LDA 分析的基础上,再进行交叉验证分析,进一步获得拉曼 光谱判别不同分子亚型乳腺癌细胞株的灵敏度和特异度。最后,使用 ROC 曲线 进一步衡量该方法在区分三种分子亚型细胞株的可行性。
结果 三种不同分子亚型的乳腺癌细胞株的平均拉曼光谱形状大致相同,各个谱 峰所在位置和谱峰特征也大致相似,但在一些主要的谱峰的谱峰强度存在一定程 度的差别,主要存在于 533 cm-1 ,723 cm-1 ,850 cm-1 ,935 cm-1 ,1100 cm-1 , 1324 cm-1 ,1448 cm-1 ,1576 cm-1 ,1607 cm-1 九个谱峰。经 PCA-LDA 分析和 交叉验证方法得出拉曼光谱鉴别 Luminal A 型细胞株、HER-2 过表达型细胞株和 三阴性型细胞株的敏感度分别为:100%、96%、100%,特异度分别为 100%、98%、 100%,且该方法区分三种分子亚型细胞株的正确率达到 97.8%。三种细胞株对 应的 ROC 曲线图,产生的 AUC 值均是 1。
结论 不同分子亚型的乳腺癌细胞株的平均拉曼光谱形状及谱峰位置大致相 似,但在 9 个谱峰的谱峰强度存在差异。显微共聚焦拉曼光谱技术可以用于区分 不同分子亚型的乳腺癌细胞株,并具有较高的敏感性和特异性。
关键词 拉曼光谱,乳腺癌,分子亚型,细胞株
Investigation on the Different Molecule Subtypes Cell Lines of Breast Cancer by Raman Spectroscopy
Abstract
Objectives: To study the different molecule subtypes cell lines of breast cancer by Raman Spectroscopy and the application value of Raman Spectra for distinguishing the molecule subtypes of breast cancer.
Methods: Three kinds of different molecule subtypes cell lines of breast cancer had been cultured, which including MCF-7(ER+/PR+/HER-2-), SKBR3
(ER-/PR-/HER-2+)and MDA-MB-231(ER-/PR-/HER-2-). Thirty-one cells in good
growth state were collected from each cell line and then detec
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