应用16SrRNA基因序列分析青海放牧牦牛瘤胃细菌多样性_崔占鸿学习.pdfVIP

33 6 ( ) Vol. 33 No. 6 第 卷 第 期 青 海 大 学 学 报 自 然 科 学 版 2015 12 Journal of Qinghai University (Natural Science Edition) Dec. 2015 年 月 应用16S rＲNA 基因序列分析青海放牧 牦牛瘤胃细菌多样性 * 崔 ， ， ， ， 占鸿 曹连宾 郝力壮 孙 璐 刘书杰 ( ， ， 青海大学畜牧兽医科学院 青海省高原放牧家畜营养与生态国家重点实验室培育基地 ， 810016) 青海省高原放牧家畜动物营养与饲料科学重点实验室 青海西宁 摘 : ， 要 以青海省海北藏族自治州刚察县全放牧牦牛瘤胃内容物为样本 使用细菌通用引物进行 16S rＲNA ， 16S rＲNA ， 瘤胃细菌 基因序列的扩增 以 序列分析技术分析牦牛瘤胃细菌多样性 16S rＲNA 。 : 114 93 OTUs ( 并构建 基因克隆文库 结果表明 获得 个非嵌合体序列属于 个 相似 97% OTUs)， 64 OTUs 16S rＲNA 97% ， 性≥ 作为一个 其中 个 与已知 序列相似性≥ 占总代表序 68. 82% ; 27 OTUs 16S rＲNA 90% ～ 96% ， 列的 有 个 与已知 序列相似性处于 占总代表序列的 29． 03% ; 2 OTUs 16S rＲNA ＜ 90% ， 2. 15% 。 93 有 个 与已知 序列相似性 占总代表序列的 这 OTUs Genebank ， (KP455685 ～ KP455713 ，KP765451 ～ KP765514)。 个 序列已向 提交 序列号为 93 OTUs ， 将 个 代表序列与已知序列构建系统发育树的分析表明 青海放牧牦牛瘤胃细菌主要 LGCGPB (the low G + C Gram positive bacteria) CFB (the Cytophaga － Flexi