准噶尔雅罗鱼遗传多样性及其同域同属种间基因渐渗分析-genetic diversity and introgression of homologous genes in the same region of yarlung fish in junggar.docxVIP

I I 摘 要 准噶尔雅罗鱼(Leuciscus merzbacheri)属鲤形目(Cypriniformes) 鲤科(Cyprinidae)雅罗鱼亚科 (Leuciscinae) 雅罗鱼属（Leuciscus cuvier ） 又名新疆雅罗鱼，仅分布于新疆准噶尔盆地，准噶尔雅 罗鱼是我国新疆特有的土著鱼类物种，也是该地区的鱼类区系中最典型的代表种。由于近年来的不 合理开发，造成这一珍贵鱼种种质资源急剧下降，面临灭绝的危险，已被列为新疆濒危野生鱼类物 种。然而，有关准噶尔雅罗鱼 DNA 分子水平遗传多样性方面的研究还属空白，尚未见有人报道，因 此，对准噶尔雅罗鱼分子遗传多样性的研究显得刻不容缓。针对这一情况，本试验以分布于新疆准 噶尔盆地的准噶尔雅罗鱼以及分布在同一水域--赛里木湖中的贝加尔雅罗鱼和高体雅罗鱼为试验材 料，使用 ISSR 分子标记技术，研究准噶尔雅罗鱼的遗传多样性，并探讨共同栖息于赛里木湖的三种 雅罗鱼亚种间是否发生基因渐渗。 本试验以采集到的准噶尔雅罗鱼 DNA 样本为模板，利用优化的 PCR 体系从 32 条引物中筛选得 到的 9 条可用于本研究的 ISSR 引物，并确定其在这一体系下各引物的退火温度。将采集到的准噶尔 雅罗鱼（3 个群体分别来自赛里木湖 sz、精河 jz、奎屯河 kz）、贝加尔雅罗鱼（1 个群体来自赛里木 湖 sb）、高体雅罗鱼（2 个群体分别来自赛里木湖 sg 和额尔齐斯河北屯河段 bg）6 个群体共 91 个样 本，分别提取 DNA 样本，并以其 DNA 样本为模板进行 PCR 扩增，6 个群体 91 个样本通过 9 条 ISSR 引物共扩增出 193 条带，片段长度在 100~2000 之间，其中多态性条带为 178 条，6 个雅罗鱼群体的 多态性位点比率（PPB）为 91.75%，表明整个雅罗鱼群体的遗传多样性水平很高。分析每个群体的 多态位点水平，6 个群体 PPB 范围：9.28%~47.94%，水平较低，群体间的遗传多样性水平高低依次 是 bgszjzsbkzsg。 将电泳图谱中清晰的条带（包括弱带）记为“1”，否则记为“ 0”，建立 0/1 数据矩阵。POPGENE3.2 软件分析群体内遗传距离（ Dc）、基因多样性指数（ Nei）、Shannon 信息指数（ I）、遗传分化系数 Gst、 基因流（Nm）等遗传多样性数据。结果表明：在物种水平上，遗传多样性高（PPB 91.75%, H 0.3352, I 0.4985），而群体内的遗传多样性水平较低；遗传分化水平较高（Gst=0.7039），基因流水平较低 （Nm=0.2103），平均遗传距离为 Dc=0.4594。 利用 Arlequin3.5 软件作分子差异（ AMOVA）分析，结果显示 45.36%的分子遗传变异来自种间， 30%的遗传变异来自群体间，而群体内部的遗传变异仅占 24.64%。物种间的遗传变异大于群体及群 体内部的遗传变异。用聚类分析软件 NTSYS-pc 构建聚类图。三种雅罗鱼 6 个群体大体聚为两个大 类群，准噶尔雅罗鱼和贝加尔雅罗鱼聚为一个类群，高体雅罗鱼聚为一个类群，而在准噶尔雅罗鱼 一簇中又聚为赛里木湖的 sz、sb 和 jz、kz 两个亚类群。结果表明，赛里木湖准噶尔雅罗鱼与贝加尔 雅罗鱼之间存在一定程度的基因交流，有发生基因渐渗的可能；而准噶尔雅罗鱼与高体雅罗鱼及贝 加尔雅罗鱼与高体雅罗鱼之间缺乏基因交流。说明准噶尔雅罗鱼比其他两种雅罗鱼表现有较强的环 境适应能力和进化潜力。 本文采用 ISSR 分子标记技术为手段，分析了准噶尔雅罗鱼的遗传多样性水平，对遗传多态性研 究可以反映物种或群体的进化历史，分析其进化潜力，还有助于对物种稀有或濒危原因及过程进行 研究；而开展准噶尔雅罗鱼与其同属鱼种之间基因渐渗方面的研究工作，将为准噶尔雅罗鱼细胞遗 传学和比较基因组学提供珍贵的背景资料，对于确定鱼类的分类地位及演化关系打下基础也为该种 资源保护提供科学依据。 关键词：准噶尔雅罗鱼，ISSR，遗传多样性，基因渐渗 II II Abstract Leuciscus merzbacheri (Zugmayer) is a genus of fish belonging to Cypriniformes，Cyprinidae， Leuciscinae，Leuciscus cuvier. Zugmayer is an indigenous medium-sized fresh or brackish fish and other two Leuciscus species (L. baicalensis and L.idus), distributed over Junggar Basi