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构建中医病因病机本体研究思路探讨
构建中医病因病机本体研究思路探讨
摘要:本文以中医方证研究与新药开发决策服务平台的近11万条病因病机术语为研究范围,探讨构建中医病因病机本体的研究思路,从而促进中医病因病机术语的规范化、标准化、信息化;加快中医药信息基础数据库的构建过程;提高文献检索的效率。
关键词:中医病因病机;本体;术语标准化研究
病机学的定义为:研究疾病发生、发展和变化的基本规律的中医基础学科,是具有中医特色的病理学。根据这一定义,病机学的内容应包括病因学、发病学、病机的构成和分类、审察病机的原则和方法等[1]。
病因病机理论是中医学关于人体疾病产生的原因及其发生、发展、变化、转归的机制和基本规律的理论,是中医学基础理论的重要组成部分[2]。在科学技术迅猛发展的今天,面对西医学和其它传统医学的激烈竞争和挑战,如何逐步实现中医学现代化、标准化、信息化,是我们面临的紧迫的战略任务。
1国内外中医病因病机术语标准化的研究现状
据不完全统计,国内已经发表的中医标准出版物共72个,其中标准机构制定的为9个,包括术语标准4个、医疗标准30个、针灸标准8个、管理标准30个[3]。
国外已开展的中医标准化相关工作包括,世界卫生组织所制定的相关标准, 如W HO相关中医标准、W H O 针灸标准等, FDA对针灸管理的相关标准, 一些国家开展的关于传统医药标准的工作, 如英国、荷兰、西班牙、菲律宾等[3]。
但上述标准中,大部分是针对疾病、征候以及治法术语进行分类,仅涉及了部分病因、病机术语,范围较小。
2国内外医学本体的研究进展
1998年,Studer为本体给出的定义为共享概念模型的明确的形式化规范说明,这是迄今为止关于本体的获得较多公认的规范定义[4]。在医学领域,很早就引入了本体的概念。国外医学术语研究已有较为成熟的医学术语本体包括UMLS(Unified Medical Language System,一体化医学语言系统)[5]、SNOMED CT(Systematized Nomenclature of Medicine -- Clinical Terms)医学系统命名法-临床术语[6]。
UMLS是美国国家医学图书馆 (NLM)从1986年开始研究的一项长期开发项目,第13版约有来自60多医学词典系列的2百万生物医学术语。
UMLS的目标是帮助研究人员从大量的数据来源中查询和整合电子生物医学信息,并能容易地连接到单独的信息系统的开发中去,例如:基于计算机的病人记录,生物数据库,事实数据库和专家系统等。NLM正在将UMLS用于自己的PubMed文献查询数据库和ClinicalT临床试验系统。
SNOMED CT是当前国际上广为使用的一种临床医学术语标准,收录有超过344000个概念,涵盖了临床医学的大多数方面,由美国病理学家协会的SNOMED-RT和英国国家卫生局的临床术语标准合并而成。其经过系统组织编排,便于计算机处理的医学术语,涵盖大多数方面的临床信息,如疾病、症状、操作、微生物、药物等。采用该术语集,可以协调不同的学科、专业对于临床数据的标引、存储、检索和聚合,有助于组织病历。
上海中医药大学医学信息化标准化研究室已经开展了中医顶层本体[7]、证候本体的探索[8]、治则治法本体[9]、方剂本体的探索[10]等多项课题的研究。本研究是在我研究室原有的基础上进一步构建病因病机本体。
3构建中医病因病机本体
我们根据Gruber在1995年提出的5条本体构建的规则[11],结合中医病因病机理论的特点,运用美国斯坦福大学开发的Protégé本体编辑器,以近11万条病因病机术语为研究范围,试着构建中医病因病机本体。具体如下。
3.1本体构建原则 ①明确性和客观性,②完整性,③一致性,④最大单向可扩展性,⑤最少约束性。
3.2本体构建方法与步骤
3.2.1确立本体的专业领域和范围 本研究以中医方证研究与新药开发决策服务平台[12](简称方证平台)收集的近11万条病因病机术语为研究对象。同时,以中医病因病机术语相关的专著、标准等为规范病机术语标准,如《中医临床诊疗术语?疾病部分》和《中医临床诊疗术语?证候部分》中的病因病机术语1824条,《中医大辞典》中的病因病机术语1288条等作为标准病因病机术语参考。
3.2.2建立本体概念框架 以中医病因病机领域本体知识为基础,构成中医病因病机领域问题的理论框架。
3.2.3定义类和类的等级体系 按照中医基础理论将病因分为外感病因、内伤病因、病理性因素、其他病因;病机分为基本病机、系统病机,基本病机包括邪正盛衰、阴阳失调、气血失调、津液失调,系统病机包括外感热病病机、内生五气病机、脏腑病机、经络病机、疾
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