一个具有进化保守序列的多变的细菌家族:Vibrionaceae最全版.pptVIP

一个具有进化保守序列的多变的细菌家族:Vibrionaceae最全版.ppt

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一个具有进化保守序列的多变的细菌家族:Vibrionaceae最全版.ppt

3. 为何弧菌科具有两条染色体 两条染色体的起源、这种排列为何能够保存下来、这种排列结构有何进化优势 * yrty 3.1小染色体的起源 两条染色体是从一个染色体分离得到的;还是小染色体是来源于古老的一个外来的遗传因子如巨大质粒 * yrty 3.1小染色体的起源 到目前所分析的弧菌科物种的生存必需基因的分配是不平等的,占绝大多数是在大染色体上。如果是分离事件发生的话,除非分离出的两条染色体的大小差别相当大,否则这些必需基因应该比较均匀地分布在两条染色体上 * yrty 3.1小染色体的起源 之前讨论的小染色体的复制起始与某些质粒的相似能更进一步地支持获得论。 而且,最近研究显示分离得到的V. cholerae(霍乱弧菌)的小染色体是自主控制的。 此外,对两条染色体上的定向进化同源基因进行分析显示,小染色体的基因序列来源于弧菌科家族以外。 * yrty 3.1小染色体的起源 反对这种理论的争论是像这样的因子能在细胞中保持下来并进化发展是很困难的 可能的情形是,质粒迅速从大染色体上获取一些必需基因从而使得质粒成为细胞所必不可少的元素 另一个更切实可行的情况是原始的巨大质粒包含一种所谓的“嗜DNA序列的组件”( addiction module cassette)像毒素/抗毒素体系toxin/antitoxin (TA) system,这种体系迫使受体细胞保持新的遗传因子 * yrty 3.2 两条染色体比一条染色体的好处 一种可以被接受的说法是,分开的染色体可更快地复制DNA从而达到更快的生长速度 ,所以弧菌科保存这种双染色体结构 事实上,一些弧菌科的菌种具有引人注目的快速生长速度:在最优条件下,复制倍增时间少于10分钟 * yrty 3.2 两条染色体比一条染色体的好处 断裂的基因组使得细胞能设法在分离的染色体间调整基因表达而满足特殊环境的要求 改变染色体拷贝数1:1的关系 不同步的复制起始 能提供给细胞一种广泛的机制去适应环境变化,这就很明显地具有进化的优势 * yrty 4.染色体特性的进化稳定性 双染色体的结构如何能够稳定地保留下来,以及为什么没有更多的必需基因易位至小染色体上 * yrty * tyuyt utyu * tyuyt utyu * tyuyt utyu * tyuyt utyu * tyuyt utyu * tyuyt utyu * tyuyt utyu * tyuyt utyu * tyuyt utyu * tyuyt utyu * tyuyt utyu 一个具有进化保守序列的多变的细菌家族:Vibrionaceae 翻译:郑燕丹 * yrty 摘 要 尽管Vibrionaceae广泛存在多样性,但他们显示出许多令人惊讶的保守特性,其中最引人注目的是无处不在的两条染色体。基于完整的基因组序列以及由此而产生的发现,我们讨论这种不平常的染色体排列的起源、进化发展和稳定性以及它的可能产生的好处。 * yrty * yrty 论文概要 1.引言 2.Vibrionaceae的染色体结构 2.1 Vibrionaceae的两条染色体结构 2.2 Vibrionaceae两条染色体的特性 2.3 染色体复制的起始 * yrty 3.为何Vibrionaceae具有两条染色体 3.1 小染色体的来源 3.2 两条染色体的优势 4.染色体的进化的稳定性 4.1 染色体的稳定性和基因含量 4.2 染色体的稳定性和高级基因组结构 5.近期发生在Vibrionaceae中的水平基因转移 6.结论 * yrty 引言 水生环境的高度多变性 革兰氏阴性,γ-变形菌纲的弧菌科,包括像费氏弧菌、一些致病的霍乱弧菌, 副溶血弧菌和创伤弧菌等 * yrty 引言 为了全面地了解、评论弧菌科菌种的多样性、生物特性,我们推荐优秀著作《The Biology of Vibrios》和全面的评论《Biodiversity of Vibrios》 * yrty 引言 几个弧菌科菌种的全部基因组序列测序已于近期完成(V. cholerae N16961, V. parahaemolyticus RIMD2210633, V. vulnificus YJ016 and CMCP6, V. fischeri ES114 and P. profundum SS9 ) * yrty 引言 分别在基因库中的号码为:AE003852 and AE003853,

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