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玉木耳RAPD分析
玉木耳RAPD分析
摘要:采用随机扩增多态性DNA (Randomly Amplified Polymorphic DNA, RAPD)技术分析玉木耳(white mutant strain of Auricularia fuscosuccinea)、九里湖木耳(A. fuscosuccinea)、黑木耳(A. auricula)8129和毛木耳(A. polytricha)781四个菌株之间的遗传差异性。结果表明,玉木耳与九里湖木耳之间的遗传相似系数大于0.99;4个菌株在遗传距离0.53的位置上可以分为三类:九里湖木耳和玉木耳为一类;黑木耳8129,毛木耳781各为一类。??
关键词:玉木耳;?A白色变异菌株;?A随机扩增多态性DNA(RAPD)??
文献标识码:S646.6; Q523??A
琥珀褐木耳(Auricularia fuscosuccinea)属担子菌亚门(Enmycophyta),担子菌纲(Basidiomycetes),木耳目(Auriculariales),木耳科(Auriculariaceae),木耳属(Auricularia)[1]。玉木耳(white mutant strain of Auricularia fuscosuccinea)是福建省三明真菌研究所在驯化栽培野生琥珀褐木耳(1997年采自福建省仙游九里湖地区,故名九里湖木耳)过程中获得的一个纯白色自然变异菌株[2]。玉木耳子实体色泽洁白、质地脆嫩、味美可口、营养丰富,外观质地与海蜇相仿,可作为其替代品,很适合国内外鲜销或作为加工原料,深受市场欢迎。多年的栽培试验证实,该白色变异菌株的白色性状能稳定遗传,且栽培产量较高,是一个极具研究和开发价值的珍稀食用菌新品种。??
为了从DNA水平上验证玉木耳与原始出发菌株――九里湖木耳的关系,确定玉木耳与九里湖木耳及木耳属其它种类之间的遗传差异,我们采用随机扩增多态性DNA (Randomly Amplified Polymorphic DNA, RAPD)技术对玉木耳等4个菌株进行了遗传差异性分析,现将试验结果报道如下。??
1 材料与方法
1.1?Σ牧?
1.1.1??供试菌株
玉木耳(white mutant strain of A. fuscosuccinea)、九里湖木耳(A. fuscosuccinea)、黑木耳(A. auricula)8129菌株和毛木耳(A. polytricha)781菌株均为福建省三明真菌研究所保藏菌种。??
1.1.2?χ饕?仪器
冷冻离心机3K30为德国Sigma公司产品。??
PCR扩增仪(AG22331 Hamburg)为德国Eppendorf公司产品。??
凝胶成像系统TANON-2008为上海天能公司产品。??
1.1.3?χ饕?试剂和引物
Taq酶、dNTPs、10×buffer缓冲液、Mg2+等均购自大连TaKaRa公司;RAPD引物为上海生工公司产品(表1);其它试剂均为进口或国产分析纯。??
1.3?Ψ椒?
1.3.1??DNA的提取
菌株于28 ℃常规液体摇瓶培养基(马铃薯200g,
葡萄糖20g,水1000 mL,pH自然)培养??12 d,用无菌纱布过滤收集菌丝体。称取1 g菌丝体置研钵中,加入液氮迅速研磨成粉末,按文献[3]中的溴化十六烷三甲基铵(Cetyltrimethyl Ammonium Bromide, CTAB)法提取基因组DNA。??
1.3.2??RAPD扩增条件
PCR扩增体系:浓度为30 ng/μL的模板DNA 1 μL, 10 × PCR buffer缓冲液2.5 μL,浓度为??25 mmol/L的 MgCl21 μL,浓度为??2.5 mmol/L的dNTP 2.5 μL,浓度为??10 μmol/L的 primer 1 μL,浓度为5 U/μL 的Taq DNA polymerase 0.25 μL,最后用ddH2O将总体积补至25 μL。??
PCR扩增程序: 94 ℃预变性7 min; 94 ℃变性1 min,35 ℃退火1 min,72 ℃延伸2 min,共35个循环;最后72 ℃补平10 min,终止温度为??4 ℃。PCR仪的升降温速率为每秒钟3 ℃。??
1.3.3??PCR扩增产物检测
取10 μL DNA反应液,于1.4%琼脂糖凝胶(含GoldviewTM DNA染料)、160 V电压电泳1 h后,于紫外凝胶成像系统上拍照。??
1.4?κ?据处理
用NTSYS-PC软件中的Simqual程序估算4个菌株的相似系数,
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