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艮泰量子化学计算模拟集群平台大型精密仪器购置论证报告
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大型仪器设备购置论证报告
仪器设备名称
量子化学计算模拟集群平台
项目名称
生态环境科技平台
项目负责人
陈建荣
填表日期
2017年7月22日
实验室管理处制
填表说明
1.单价10万元及以上仪器设备的申购均需填写此表,并与申购计划一起上报有关部门。
2.所在学院(部门)组织3—7人单数技术专家进行论证,并通知项目经费管理、设备管理等部门参加论证。申请单一来源采购的需3人以上单数非本校专家参加论证;未列入全省统一论证进口产品范围的进口产品需5人以上单数非本校专家参加论证。
3.论证会由专家组组长主持,主要程序为:申购人报告、现场考察、专家质询与讨论、专家组形成论证意见并签名。
4.专家论证同意,经学院(部门)、项目经费管理部门签字并盖章后,报本科教学部(实验室管理处)网上公示一周无异议后实施。
5.此表一式1份(如设备为进口设备,请提交2份)。
设备名称
中文
艮泰量子化学计算模拟集群平台
英文
Quantum chemistry simulation cluster platform
规格型号
QS012G2GHIEIE
申购数量
1套
现行单价
人民币
23.5万
美元
购置经费
来源
省重点高校建设运行经费
运行经费来源
省重点高校建设运行经费
主要技术指标与功能
理论双精度浮点运算能力4300.8Gflops
1个平台管理与存储节点:2颗Intel Xeon E5-2683 v4十六核CPU,共计32个物理计算核心,主频2.1GHz,40MB高速智能三级缓存,Nvidia Quadro K420专业图形显卡,2GB GDDR3显示存储,192个CUDA处理核心;64GB(8*8GB)内存;512GB SSD固态硬盘+三块4TB企业级SATA硬盘;通讯端口基于最新PCI-E 3.0总线,满足并行计算低延迟的要求;支持多种扩展接口,方便后续升级。
3个计算节点,每个节点包含:2颗Intel Xeon E5-2683 v4十六核CPU,共计32个物理计算核心,主频2.1GHz,40MB高速智能三级缓存;64GB(8*8GB)内存;256GB SSD固态硬盘;通讯端口基于最新PCI-E 3.0总线,满足并行计算低延迟的要求;支持多种扩展接口,方便后续升级。
安装操作系统基于64位LINUX操作系统,系统稳定。提供用于满足高性能并行量子化学计算的环境,安装各种常用科学计算库如LAPACK、ScaLAPACK、FFTW等及其他办公套件、作图软件、 编译器以及常用并行计算环境如OpenMP等,对常见的科学计算软件提供可靠的支持,充分发挥硬件的计算能力。
基于16口千兆以太网架构,RJ45高性能六类网线,确保高速传输。
集群综合管理系统,支持远程管理,实现集群监控功能,后台采用数据库以支持集群历史运行状态信息的保存。
提供对集群各计算节点的界面监控。含一台21.5英寸液晶显示器,光电键鼠套装和8口KVM,以快速切换。
用房情况
地 点
面积
辅助设施配备
是否
需改建
落实
情况
8幢301
26 m2
否
已落实
管理和使用技术人员配备
姓 名
职称
专管
或兼管
是否
使用过
熟练
程度
是否
需培训
马广才
讲师
专管
是
熟练
不需要
于海瀛
副教授
兼管
是
熟练
不需要
洪华嫦
副教授
兼管
是
一般
不需要
主要用途和适用学科范围
该设备提供大规模并行量子科学计算模拟平台,包括MPI并行计算环境、科学计算数学库及编译器安装调试和系统优化服务,采用基于MPICH2和OpenMP混合并行架构的“1+3”集群系统。系统集成密度泛涵理论(DFT)、量子力学(QM)和分子动力学(MD)框架模块,包括ABINIT PWSCF LAMMPS NWCHEM PACKAGE,可以解决量子化学、固体物理、材料科学、化学和材料工程中的固体、分子、表面和界面问题,高性能硬件计算资源采用Intel Xeon E5系列处理器,大容量、高带宽、超快内存,可处理要求苛刻的科学计算任务,系统平台理论双精度峰值浮点计算能力不低于4300.8Gflops。
适用学科范围:环境科学、化学、生物科学、材料科学
购置必要性
在环境污染物的形成、理化性质、生物活性以及毒理研究中,计算毒理学正发挥越来越重要的作用。理论计算不仅可以验证实验结果,还可以从分子水平上揭示反应路径和生物活性的化学机制,正逐渐成为研究环境污染物形成机理和毒性作用的重要工具,也是我院环境学科发展的一个重要方向。鉴于科研工作的需要,我们购置了经典的量子化学及分子模拟软件,如Gaussian,Material Studio等,但目前学院仅有一台曙光服务器(购置于5年前,使用AMD Opteron6272处理器)和三台高性能电脑,不能搭建集群平台
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