二倍体和四倍体泥鳅全基因组DNA甲基化的比较-华中农业大学学报.PDF

第 卷 第 期 华 中 农 业 大 学 学 报 ３７ ５ 　 　 　 　 　 　 　 Vol．３７　No．５ 年 月 , ２０１８ 　９ JournalofHuazhon A riculturalUniversit Se．２０１８９５~１０３ g g y p 二倍体和四倍体泥鳅全基因组 DNA 甲基化的比较 张曼曼 冯 兵 罗双双 王卫民 周小云 　 　 　 　 　 / , 华中农业大学水产学院 农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室 武汉 ４３００７０ , ( ) 摘要 以二倍体和四倍体泥鳅为研究对象 采用甲基化修饰依赖性内切酶测序技术 在全 　 MethlRADＧSe y q . 基因组水平上分析泥鳅的 DNA甲基化特点及倍性间的 DNA甲基化变异 测序结果共得到 ３０２１１１６８４条 . , ( ), MethlＧRAD序列标签 与参考基因组比对结果显示 泥鳅的甲基化位点主要分布在基因体区 enebod 其 y g y ( ) ( ), . 次为内含子区 intron和基因间区 interenic 而在其他功能元件上的分布较少 四倍体泥鳅的整体甲基化水 g , (st ) ( ), 平比二倍体高 尤其是在第一外显子区 和转录起始位点上游 至 区 且倍性 １Exon １５００b ２００b TSS１５００ p p ( ). , . 间差异极显著 P＜０．０１ 但在启动子区 四倍体泥鳅的甲基化水平略低于二倍体 在二倍体和四倍体泥鳅间 m m , 、 共筛选到 个差异甲基化 位点和 个差异甲基化 位点 这些位点主要分布于内含子 基 １２６８ C CGG １４ C CWGG .