赖氨酸胍基化对蛋白质组分析的影响-色谱.PDF

２０１４年４月 Ｖｏｌ．３２ Ｎｏ．４ Ａｐｒｉｌ ２０１４ ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ ３７６～３８０ 庆祝《色谱》创刊三十周年暨卢佩章院士九十华诞专刊⁃研究论文 ＤＯＩ：１０．３７２４／ ＳＰ．Ｊ．１１２３．２０１４．０１００３ 赖氨酸胍基化对蛋白质组分析的影响 １，２ １，２ １，２ １，２ 郑　 昊 ，　 毛家维 ，　 潘彦博 ，　 刘忠山 ，　 １，２ １∗ １∗ 刘哲益 ，　 叶明亮 ，　 邹汉法 （１． 中国科学院分离分析化学重点实验室，国家色谱研究分析中心，中国科学院大连化学物理研究所， 辽宁 大连 １１６０２３；２． 中国科学院大学 北京 １０００４９） 摘要：赖氨酸胍基化在蛋白质组学定性和定量研究中起着重要作用，本文系统分析了胍基化前后，ＨｅＬａ 细胞蛋白 质经胰蛋白酶酶解产生的３种不同类型肽段的质谱鉴定情况，并探讨了不同肽段质谱响应改变的内在原因。 发现 赖氨酸在侧链能选择性地发生胍基化反应（其选择性达到９６８％），转化为高精氨酸，碱性增强。 因此在正离子质 谱模式下，Ｃ端为赖氨酸的肽段产生了更多的ｙ离子，提供了许多新的离子碎片信息。 在鉴定结果中，此类肽段所 占总肽段的比例由原来的５１７％上升为５７３％，并且有 １０１５条新的肽段被检测到。 对于不含有赖氨酸的肽段，其 鉴定结果在胍基化前后基本没有变化。 结果表明，胍基化可以在一定程度上提高质谱鉴定的灵敏度和互补性，提 高蛋白质分析的覆盖率。 关键词：质谱；蛋白质组学；胍基化；肽段碎裂 中图分类号：Ｏ６５８　 　 　 文献标识码：Ａ　 　 　 文章编号：１０００⁃８７１３（２０１４）０４⁃０３７６⁃０５ Ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｔｈｅ ｌｙｓｉｎｅ ｇｕａｎｉｄｉｎａｔｉｏｎ ｏｎ ｐｒｏｔｅｏｍｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ １，２ １，２ １，２ １，２ ＺＨＥＮＧ Ｈａｏ ，ＭＡＯＪｉａｗｅｉ ，ＰＡＮ Ｙａｎｂｏ ，ＬＩＵ Ｚｈｏｎｇｓｈａｎ ， １，２ １∗ １∗ ＬＩＵ Ｚｈｅｙｉ ，ＹＥ Ｍｉｎｇｌｉａｎｇ ，ＺＯＵ Ｈａｎｆａ （１．ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｓｅｐａｒａｔｉｏｎ ＳｃｉｅｎｃｅｆｏｒＡｎａｌｙｔｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，Ｎａｔｉｏｎａｌ ＣｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｉｃＲｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｃｅｎｔｅｒ，Ｄａｌｉａｎ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ ＣｈｅｍｉｃａｌＰｈｙｓｉｃｓ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｄａｌｉａｎ １１６０２３，Ｃｈｉｎａ； ２． Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００４９，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｈｅ ｇｕａｎｉｄｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ ｌｙｓｉｎｅ ｓｉｄｅ ｃｈａｉｎ ｗａｓ ｐａｉｄ ｇｒｅａｔ ａｔｔｅｎｔｉｏｎ ｉｎ ｒｅｃｅｎｔ ｙｅａｒｓ． Ｉｔ ｐｌａｙｓ ａｎ ｉ