长江华溪蟹线粒体基因组及其种群遗传结构的研究.pdfVIP

!奎塑耋 一 一—— 长江华溪蟹线粒体基因组及其种群遗传结构研究 吕秀玲 (南京师范大学生命科学学院遗传研究所，南京210097) 摘 要 淡水蟹类是短尾类(Brachyuran)中完全适应淡水生活的一个特殊类群。长 江华溪蟹(Sinopotarnonyangtsekiense)是一种我国特有的淡水蟹类。本文以长江 华溪蟹为代表，通过对线粒体基因组序列的测定，从基因序列和排列顺序2个方 面探讨淡水蟹类在短尾类中的系统地位；并利用COl和ND5基因的部分序列数 据，对我国长江华溪蟹种群的遗传结构进行了初步研究。 i．长江华溪蟹线粒体基因缎及十足日系统发生研究测定了长江华溪蟹线 粒体基因组11，405bp的核苷酸序列，包括11条蛋白编码基因和17条tRNA基因。 已测定的长江华溪蟹线粒体基因排列与原始的十足类线粒体基因顺序相比，1个 loss)是长江华溪蟹trnH基因的易位的可能机制。基 丢失(duplication／random 于合并的4种蛋白编码基因(coxl～3，cob)和11种蛋白编码基因(除末完成测定 的nadl和nod2基因)的2组序列数据所构建的十足类的系统发生关系显示，十 列顺序的系统发生研究结果提示，在十足类进化分支(advancedclade)的系统 本文基于基因序列和排列数据的系统发生分析都支持短尾类是一单系群；异孔类 和胸孔类互为姐妹群；以长江华溪蟹为代表的溪蟹总科(Potamoidea)与扇蟹总 科(Xanthoidea)、梭子蟹总科(Portunoidea)有较近的亲缘关系。 以COI和ND5基 2．用线粒体DNA标记探讨长江华溪蟹种群的遗传结构 因的部分序列作为分子标记，采集了长江华溪蟹12个地方种群的80个样品，测 定了COI基因657bp和ND5基因549 bp长的片段，分别检测出29和35个单 元型。重建的系统发生树和最小跨度网络图均显示长江华溪蟹种群明显分化成两 大分支：(1)江淮支，代表来自长江和淮河流域的种群，都为腹肢末节平直型的 指名亚种；(2)桐陕支，代表来自桐柏和陕县的种群，包括稍向内弯的桐柏亚种 和明显内弯的陕县亚种。这两大支间的遗传距离达到了8．35％(COI)。长江和淮 中文摘要 河种群具有较高的遗传多样性，桐柏种群的遗传多样性较低，陕县种群的遗传多 样性最低。单元型歧点分布分析表明长江和淮河种群长期处于较稳定的状态；约 115．000～135，000年前桐柏种群经历过种群扩张，这个扩张时间和陕县种群的种 经历过种群扩张。结合历史上的地质事件和遗传标记所提供的遗传信息，我们认 为(1)第三纪中期到后期东秦岭一桐柏一大别山脉的隆起可能是造成两大支系分 化的主要原因；(2)桐柏种群是古老种群在该山地内的孑遗，陕县种群起源于桐 柏种群的近期扩张事件；(3)长江和淮河流域一直是长江华溪蟹适宜的栖息地， 在第四季冰期很可能未受影响，或影响甚微；(4)桐柏亚种和陕县亚种种群问极 低的遗传差异(仅0．84％)还未达到划分亚种的水平。 依据形态学特征，尤其是雄性第一腹肢末端的弯曲程度，已有的分类系统将 桐柏及附近地区，其雄性第1腹肢末节稍弯向背内方；陕县亚种(Sy． 长江华溪蟹种群遗传结构的研究结果提示，长江华溪蟹分化为两个亚种，一是雄 性第1腹肢末节呈平直型的指明亚种；另…是雄性第l腹艘末节弯向背内方的内 弯型，包括捎向内弯的桐柏亚种和明显内弯的陕县贬种在内。建议将桐柏亚种和 陕县亚种合并为一个亚种。 关键词：长江华溪蟹线粒体基因组基因重排COIND5种群结构 Ⅱ 茎茎塑塞 —-——-—————————__--_-_____●-_●●————————————_—_———————————___--_____—————————一一 and