PCR仪器的使用及注意事项研究报告.pptxVIP

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  • 2018-10-17 发布于天津
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PCR仪器的使用及注意事项研究报告.pptx

实时荧光定量PCR仪使用PCR仪器 line9620BIO-RAD CFX96 QuantStudio3 ABI7500实验类型:定量标准曲线(Quantitation-Standard Curve)相对定量标准曲线(Quantitation-Relative Standard Curve )定量CT比较法(Quantitation-Comparative Ct ΔΔCt)溶解曲线(Melt Curve )基因分型(Genotyping)定性实验(Presence/Absence)绝对定量相对定量: 绝对定量的目的是测定目的基因在样本中的分子数目,即通常所说的拷贝数.相对定量的目的是测定目的基因在两个或多个样本中的含量的相对比例,而不需要知道它们在每个样本中的拷贝数. 绝对定量实验必须使用已知拷贝数的绝对标准品,必须做标准曲线.相对定量可以做标准曲线,也可以不做标准曲线. AB7500绝对定量1、双击桌面图标 ,或从 Start All Programs Applied Biosystems 7500 Software 7500 V2.0 开启软件。进入主界面后选择 Advanced Setup。2. 默认进入 Setup 下的 Experiment Properties 界面 2.1 输入实验名称 ( Experiment Name) 2.2 确认仪器型号 2.3 在实验类型中,选择 Quantitation-Standard Curve2.4 选择试剂种类2.5 确认运行模式TaqMan探针法(寡核苷酸探针): 5′ 端 荧光报告基团 与靶基因特异性结合的序列 3′ 端 淬灭基团 完整的探针:检测不到报告荧光 切断的探针:检测到报告荧光 5′-3′外切酶活性将探针酶切降解? 水解探针,使报告基团和淬灭基团分离淬灭基团报告基团3. 进入 Setup 下的 Plate Setup 界面,编辑基因( Target)及样本( Sample)3.1在界面中设置基因及样品, 添加新的基因,并在Target name编辑基因名称,Reporter和Quencher中选择所标记的荧光基团及淬灭基团; 利用 添加新的样本,并编辑样品名称。3.2在 界面中进行样品板的排布分配 S :标准曲线数据点, U :未知样本, N :阴性对照 勾选基因 勾选样本名称3.3 设置标准曲线:利用鼠标单选或拖曳以选择反应孔(一般情况下,每个 梯度设置三个副孔),而后勾选左侧的基因,在Task选项中选择S, 在Quantity中输入拷贝数。按照相同操作,完成标准曲线其他数据点的设 置(建议5个梯度)。标准曲线:标准品 目的:生成标准曲线,建立Ct值与浓度之间的线性关系标准曲线的制备:至少5个点的10倍标准曲线 10倍连续梯度稀释方法:1v原液(标准品i) +9v稀释缓冲液,得标准品ii1v标准品ii+9v稀释缓冲液,得标准品iii1v标准品iii +9v稀释缓冲液,得标准品iv1v 标准品iv +9v稀释缓冲液,得标准品v 不可由标准品i分别加不同体积的稀释缓冲液直接得到标准品ii、 iii、 iv、 v4. 在 Setup 下的 Run Method 界面中,设定反应条件。5、点击 文件储存成 Experiment Document Single Files( *.eds)格式, 然后在 按下 按钮,反应即开始进行。6、实验结束后,点击界面右上角的 Analyze 按钮,软件将会显示实验结果:7、查看标准曲线时,可通过更改Plot Settings来改变标准曲线的显示方式。 Eff%代表扩增效率(Eff% :90%—110%)。 R2值代表标准曲线的数据点与回归曲线的接近程度, ≥ 0.998、对于 SYBR Green 法实验,可以在 Melt Curve 界面中查看熔解曲线。9、检测 QC Summary 结果,可以快速查看实验中是否有反应孔存在异常情 况。黄色三角形中的数字 1代表有一种异常情况,2代表有两种异常情况, 以次类推。详细信息及解决方案可以在 Flag Details查看。10、分析之后的结果,可以利用菜单中的 FileExport 功能,导出 Excel 格式的结果。或者 视图板布局选中所需孔位右击Copy,粘贴。若想存储图片结果,可直接在图片上单击鼠标右键,选择 Save as,存成 JPEG 格式的图片。数

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