个新的Br蛋白基因部分序列测定及分析.PDFVIP

维普资讯 遗 传 HEREDIIAS(Beijing)26(3)：343～348。2004 研 究 报 告 一 个新的Br蛋白基因部分序列测定及分析 许学伟 ，吴 敏 ，阮 红 ，黄伟达 ，迪丽拜尔 ·托乎提。 (1．浙江大学生命科学学院，杭州 310027；2．复旦大学生命科学学院，上海 200433；3．新疆师范大学生物系，乌鲁木齐 830054) 摘 要：从新疆北部艾 比湖分离纯化到极端嗜盐古生菌AB1，采用PCR方法扩增了其 l6SrRNA基因(165rDNA) 和编码螺旋 C至螺旋 G的细菌视紫红质 (bacteriorhodopsin，Br)蛋 白基因片段 ，并测定了基因的核苷酸序列。基于 16SrDNA序列的同源性 比较及系统发育学研究表明，AB1是 Natronococcus属中新成员。通过对菌株 AB1的Br 蛋白亲水性分析表明，AB1的Br蛋白与已报道 Br蛋白有类似的超二级结构，进一步的蛋 白质序列聚合比对结果 表明，AB1中Br蛋 白螺旋 C至螺旋G的氨基酸序列与其他菌株差异明显。研究结果表明菌株 AB1的Br蛋 白是 一 种新 的Br蛋 白。 关键词：嗜盐古生菌；细菌视紫红质；l6SrDNA 中图分类号：Q517，Q78 文献标识码 ：A 文章编号：0253—9772(2004)03—0343—06 AnalysisofPartialSequenceoftheGeneforA NovelBrProtein XU Xue—W ei，WU Min ，RUAN Hong 。HUANG W eiDa ，DilbarTohty。 (1．CollegeoJ’LifeSciences，ZhejiangUniversity，Hangzhou310027，China； 2．CollegeofLireSciences，FudanUniversity，Shanghai200433，China； 3．DepartmentofBiology，XinjiangNormalUniversity，Urumqi830054．China) Abstract：A strainofhalophilicarchaeum AB1wasisolatedandpurifiedfrom AibilJakelocatedinthenorthofXin— jiangUygurAutonomousRegion．PartialDNA fragmentencodingabateriorhodopsin (Br)proteinaswellasl6S rRNA ofAB1wasamplifiedbyPCR，andtheirnucleotidesequencesweredeterminedsubsequently ． Onthebasisof homologyandphylogneticanalysisabout165rRNA gene(165 rDNA)，itcouldbespeculatedthatthestrainAB1is anovelmemberofthegenusNatronococcus．ThehydrophathyanalysisofBrfragmentrevealedthattheAB1Brhad atransmembraneheptahelicalstructuresimilartothatofotherBrs．Ontheotherhand，homologyalignmentusing thededuced