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- 2018-11-06 发布于江苏
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第一章 化学物学方法
(1)小分子微阵列检测 借鉴DNA芯片技术,人们发展了一种称为小分子印迹(small molecule printing)的技术,后来改称为小分子微阵列检测技术(small molecule microarrays,SMM)来筛选靶蛋白的小分子配体。小分子微阵列是一种新的高通量鉴定蛋白质结合的小分子配体的方法,有时又称为化学芯片。 小分子微阵列是一种具有1000-100000个探针部位对称排列整体的平面,每个探针部位可以含有通过共价或非专一性吸附固定化的小分子化合物(如多肽、糖、类药物分子、天然产物等)。 首先,将应用组合化学合成的小分子分别溶解在适当溶剂中,采用高精度的机器人将1nl含有每一种小分子的样品溶液精确定位点样于一块经过处理的载片上,所有的化合物都含有共同的连接反应官能团,可以通过共价键的形式将小分子固定在载玻片上,从而形成高密度的小分子阵列(1000个点/cm2)。 用荧光标记的蛋白质探出需要的小分子配体,在载玻片洗涤除去非专一性吸附的蛋白质后,可以通过扫描荧光斑点证实哪个小分子与蛋白质发生了较强的相互作用。在此基础上,这些小分子可以依次被多种标记的靶蛋白分别进行筛选。该方法选择性好,灵敏度高。 在小分子芯片(SMM)制备过程中,小分子的固定是极其关键的步骤,因为它决定了小分子以哪种方式与靶蛋白相互作用,也决定了在合成期间应该引入哪些化学基团以便得到均匀固定化的小分
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