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- 2018-11-02 发布于福建
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破布木果基因组DNA不同提取的方法比较的研究
破布木果基因组DNA不同提取的方法比较的研究
摘要:目的 采用不同方法对维药破布木果基因组DNA进行提取,为破布木果基因组DNA的研究提供参考。方法 采用改良CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)法和改良SDS(十二烷基磺酸钠)法提取破布木果基因组DNA,并采用分光光度法和琼脂糖凝胶电泳技术检测提取DNA的纯度和浓度。结果 分光光度法检测结果表明,用改良CTAB法提取的基因组DNA纯度优于改良SDS法,无蛋白质和RNA污染。琼脂糖凝胶电泳结果表明,2种方法提取得到的基因组DNA电泳图谱均有明显的主带出现,但改良SDS法提取的基因组DNA降解较多。结论 改良CTAB法可以提取相对较高质量的破布木果基因组DNA。
关键词:破布木果;基因组DNA提取;CTAB法;SDS法
DOI:10.3969/j.issn.1005-5304.2015.05.025
中图分类号:R282.5 文献标识码:A 文章编号:1005-5304(2015)05-0091-03
Abstract:Objective To extract high quality genomic DNA of Cordia dicholoma seeds by using different methods;To provide references for researches on genomic DNA of Cordia dicholoma seeds. Methods Genomic DNA of Cordia dicholoma seeds was extracted through improved CTAB method and improved SDS method. Purity and concentration of obtained DNA were detected by spectrophotometry and agarose gel electrophoresis. Results The results of spectrophotometry showed that the purity of genomic DNA obtained through improved CTAB method was better than improved SDS method. Genomic DNA extracted through improved CTAB method was without protein and RNA pollution. The results of agarose gel electrophoresis showed that electrophoresis of genomic DNA obtained through the two methods both had the main belt. However, genomic DNA extracted through improved SDS method degraded more than improved CTAB method. Conclusion Improved CTAB method can obtain relatively high quality genomic DNA of Cordia dicholoma seeds.
Key words:Cordia dicholoma seeds;extraction of genomic DNA;CTAB method;SDS method
维药破布木果为紫草科Boraginaceae植物破布木Cordia dicholoma Forst.f.的干燥成熟果实,是现代维吾尔医常用药,具有降血压作用,为维药制剂祖卡木颗粒的组方药物之一[1-2]。目前已有破布木果化学成分的提取研究[3-4],但从种质特性入手研究破布木果遗传多样性尚未见报道。
分子生物学研究的前提是DNA提取,但不同植物组织的组分各异,提取DNA的难易程度不同。破布木果为干燥果实,其化学成分主要为多糖、植醇及其他次生代谢物质。干药材不同于新鲜的动植物药材,其干燥、加工、贮藏等过程均可造成DNA不同程度降解,因此,破布木果所含DNA有所降解,且其含有的黏液质、多糖和色素等次生代谢物质使高质量基因组DNA提取较为困难,需要采用合适的提取方法才能得到符合要求的DNA。常用的植物DNA提取方法主要有CTAB (十六烷基三乙基溴化铵)法和SDS(十二烷基磺酸钠)法[5]。因此,本研究在传统CTAB法和SDS法的基础上,参考文献[5-9]对2种方法加以改进,并用分光光度法和琼脂糖凝胶电泳法对这2种方
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