计算机辅助药物分子的设计教学的改革初探.docVIP

计算机辅助药物分子的设计教学的改革初探 　　摘 要：计算机辅助药物分子设计作为一门发展迅速的交叉学科，在新药的开发研究过程中发挥着越来越重要的作用。该课程知识更新速度快、专业性强，有助于提高生物、医学和药学学生的专业素养。为了提高计算机辅助药物分子设计的教学水平，该文结合河南科技大学化工与制药学院相关专业的现状，从教学内容的选择、相关专业软件的学习及课程考核体系等方面提出了该课程教学改革中的一些问题和具体建议。 　　关键词：计算机辅助药物分子设计；教学改革；研究生课程 　　中图分类号 G642 文献标识码 A 文章编号 1007-7731（2017）02-03-0105-03 　　Abstract：Computer aided drug molecular design，as a rapidly developing interdisciplinary subject，has played an increasingly important role in the development and research of new drugs. The course knowledge updates speed and is highly professional. Learning this course will help improve the professional quality of students in biology，medicine and pharmacy. Combined with the present situation of the computer aided drug molecular design teaching in Henan University of Science and Technology，the ideas of reform have been put forward from three aspects consisting of selection of teaching content，related professional software learning and the examination system of the course. 　　Key words：Computer aided drug molecular design；Teaching reform；Postgraduate courses 　　?S着人类基因组测序工作的完成，海量的生物学数据为人类疾病的预测、诊断、预防和治疗提供了最合理、有效的方法或途径，同时也为新药的研究和开发带来了前所未有的机遇和变革。药物的研究与开发是一个长周期、高投入而又学科密集的系统工程。1964年，Hansch提出了药物结构与生物活性之间的定量构效关系，计算机技术开始得以进入医学领域并应用于药物设计。在过去的数十年中，随着计算机技术的迅速发展以及分子生物学、量子化学、分子力学、药物化学等多门学科的加入，计算机辅助药物分子设计逐渐完善并趋于成熟，出现了多项成功的设计案例，大大缩短了新药的研发周期并提高了成功率[1]。国内外许多制药企业和公司的研发部门在药物的研发过程中，充分利用计算机技术和手段预测药物靶点、确定作用位点、评价药物的动力学性质、毒理学行为等[2]。计算机辅助药物分子设计的理论和应用研究已成为药物分子设计过程中不可或缺的环节，也是医学、药学、生物学等从业人员的必备技术之一[3]。目前，全国多所高校及科研院所已经开展了计算机辅助药物分子设计的教学工作，笔者所在的河南科技大学化工与制药学院也将此门课作为本科和研究生的选修课程。该门课程信息量大，知识更新速度快，对学生的实践操作能力要求较高。笔者在计算机辅助药物分子设计的教学过程中不断探索和积累经验，在对学生的授课过程中取得了较好的教学效果。 　　1 教材的选择和授课内容的选取 　　目前计算机辅助药物分子设计已有很多相关书籍出版，选择合适的教材和教学内容是保证教学质量的关键。针对我院相关专业的特点，笔者选择的参考教材为魏冬青等编著的《分子模拟与计算机辅助药物设计》，朱瑞新编著的《计算机辅助药物设计――基本原理概要与实践详解》和施耐德著、唐?S编译的《药物分子设计――从入门到精通》。其中《分子模拟与计算机辅助药物分子设计》这本书详细介绍了计算机辅助药物分子设计方法以及相关的理论计算方法，包括分子模拟的数学、生物学、物理和化学基础，蛋白质结构的模拟，药物设计的基本方法和信息系统等内容，并列举了不少药物设计的实例。而《计算机辅助药物设计――基本方法原理概要与实践详解》对于理论部分的介绍尽量做到简明扼要，而对于实践操作的讲解尽量做到详细，内容涵盖