基因和基因组(生物化学)(精品·公开课件).ppt

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 大肠杆菌强启动子 TTGAC TATAAT 转录起始 * G AC C G C C G C UG G C G G C A U U U U-OH 3’ 5’ U U C G G 5’…GCCGCCAGUUCGGCUGGCGGCAUUUU…3’ RNA 5’…GCCGCCAGTTCGGCTGGCGGCATTTT… 3’ DNA 终止子： 强终止子：有反向重复顺序，可形成茎环结构，其后面为poly(T)结构，转录终止无需ρ因子。 GC丰富区、AT丰富区 * （六）质粒（plasmid） 质粒是存在于细菌染色体外的，具有自主复制能力的环状双链DNA分子；大小为2-3 kb。 * 质粒的特性 在宿主细胞内可自主复制； 所携带的遗传信息能赋予宿主特  定的遗传性状； 细胞分裂时恒定地传给子代； 质粒可以转移。 * 三真核生物基因组 染色体DNA线粒体DNA * 人类基因组染色体 （一）染色体DNA的组成 核小体 * 1. 单一序列DNA（unique sequence DNA ） 单一序列在人类基因组中大于50％。结构基因主要存在于单一序列中。 单拷贝DNA(single copy DNA) * 2. 高度重复序列DNA （highly repetitive DNA） 卫星DNA（satellite DNA） 反向重复序列 （inverted repeats) 重复次数106次 * （1） 卫星DNA 存在于非编码区的串联重复序列， 在基因组中约占5％。 主带 光 密 度 卫星DNA * a. 大卫星（macro-satellite）DNA： 重复单位5-10 bp，其在人群中多态性不显著。 光密度260nm 果蝇基因组 * b. 小卫星（minisatellite） DNA： 重复单位9-24 bp，呈高度多态性。 可变数目串联重复序列（variable  number of tandem repeat,VNTR） 端粒DNA：（TTAGGG）n，2-20 kb，  染色体复制，末端保护。 核心序列 GGGCAGGAXG； * c. 微卫星DNA (macro-satellite DNA) 短串联重复(short tandem repeat,STR) 重复单位2-6bp，常见为(AC)n和(TG)n， 重复次数10-60次，总长度小于150bp， 高度多态性，可作遗传标记。 * （2）. 反向重复序列 5`AAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTT3`3`TTTGGTGGCGACCATCGCCACCAAA5` 5`AAACCACCGCTAGCGGTGGTTT3`3`TTTGGTGGCGATCGCCACCAAA5` 回文结构 两个顺序列相同的拷贝在DNA链上呈反向排列。在基因组中约占5％，常见于基因调控区。 * 3.中度重复序列: tRNA、rRNA 组蛋白、免疫球蛋白 可能与基因调控相关序列 重复次数10-105，约占基因组的35％ * Alu家族： 有AluⅠ酶切位点（AG/CT）而得名。 重复单位约300bp，  由两个130bp重复序列及31bp间隔序  列组成；重复30-50万次，散在分布； 灵长类特有。 * 等位型1 等位型2 （二）基因组序列多态性 两个同源DNA序列中同一碱基位置含有不同的核苷酸。 1.单核苷酸多态性（single  nucleotide polymorphism,SNP） * 2. 限制性片段长度多态性 （restriction fragment length  polymorphism） ↓ ↓ DNA1-1 ↓ DNA1-2 用一种限制性内切酶消化不同个体的同一段DNA时，由于碱基组成的变化而改变限制性内切酶识别位点，从而会产生长度不同的DNA片段。 * (三) 多基因家族（multigene family） 1.基因超家族（supergene family） 由多基因家族及单基因组成，成员间有不同程度的同源，但它们的功能不一定相同。 是指一组有类似功能，核苷酸序列又有同源性的基因。 * 2.核酸序列相同：  组蛋白基因家族 多拷贝基因形成的基