麻竹笋转录组测序及苦涩味物质合成基因差异表达分析-林业科学研究.PDF

林业科学研究　２０１８，３１（４）：３８ ４６ ＦｏｒｅｓｔＲｅｓｅａｒｃｈ 　　ＤＯＩ：１０．１３２７５／ｊ．ｃｎｋｉ．ｌｙｋｘｙｊ．２０１８．０４．００６ 麻竹笋转录组测序及苦涩味物质合成基因 差异表达分析 １ １ １ ２ １ １ 李露双 ，董文慧 ，丁兴萃 ，章志远 ，孙春娃 ，蔡函江 （１．国家林业局竹子研究开发中心，浙江 杭州　３１００１２；２．浙江人文园林股份有限公司，浙江 杭州　３１００１２） ＴＭ 摘要：［目的］研究避光处理对麻竹笋苦涩味物质合成相关基因表达的影响。［方法］利用ＩｌｌｕｍｉｎａＨｉＳｅｑ ２５００平 台对自然生长（ＣＫ）和覆土处理（ＥＰ）２种类型的麻竹笋进行转录组测序，并对差异表达基因进行分析。［结果］转 录组测序共获得３６．４５Ｇｂ原始数据，经组装去冗余处理得到５３３８８个 Ｕｎｉｇｅｎｅ，将所得 Ｕｎｉｇｅｎｅ比对到Ｎｒ、Ｐｆａｍ、 ＣＯＧ、Ｓｗｉｓｓｐｒｏｔ、ＧＯ和ＫＥＧＧ数据库中进行功能注释，发现共有３１４６２条 Ｕｎｉｇｅｎｅ与其它物种的基因具有同源性。 对ＣＫ和ＥＰ处理所测得的Ｕｎｉｇｅｎｅ进行表达量的比较分析，筛选出１８４６个差异基因，其中，在ＥＰ处理中上调表达 基因９９８个，下调表达基因８４８个。由ＫＥＧＧ代谢通路分析发现，差异基因显著地富集在３２个代谢途径中，其中， 包含与苦涩味物质合成相关的糖酵解途径、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸合成途径等。进一步研究发现，参与麻竹笋 芳香族氨基酸、单宁合成的ＰＦＫ、ＥＮＯ、ＰＰＹＡＴ／ＨＰＰＡＴ、ＬＡＲ等酶基因在ＥＰ处理中表达量下降，荧光定量ＰＣＲ验证 结果与测序结果基本一致。［结论］避光处理抑制了苯丙氨酸、酪氨酸、单宁生物合成关键酶基因的表达，可能最终 影响麻竹笋苦涩味物质的合成。 关键词：麻竹笋；避光；转录组测序；苦涩味物质；差异表达基因 中图分类号：Ｓ７１８．４６；Ｓ７９５．５ 文献标识码：Ａ　　　文章编号：１００１１４９８（２０１８）０４００３８０９ ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅＳｅｑｕｅｎｃｉｎｇａｎｄＤｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＢｉｔｔｅｒａｎｄ ＡｓｔｒｉｎｇｅｎｔＳｕｂｓｔａｎｃｅｓＢｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓＲｅｌａｔｅｄＧｅｎｅｉｎＤｅｎｄｒｏｃａｌａｍｕｓｌａｔｉｆｌｏｒｕｓ １ １ １ ２ １ １ ＬＩＬｕｓｈｕａｎｇ，ＤＯＮＧＷｅｎｈｕｉ，ＤＩＮＧＸｉｎｇｃｕｉ，ＺＨＡＮＧＺｈｉｙｕａｎ，ＳＵＮＣｈｕｎｗａ，ＣＡＩＨａｎｊｉａｎｇ （１．ＣｈｉｎａＮａｔｉｏｎａｌＢａｍｂｏｏＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒ，Ｈａｎｇｚｈｏｕ　３１００１２，Ｚｈｅｊｉａｎｇ，Ｃｈｉｎａ； ２．ＺｈｅｊｉａｎｇＨｕｍａｎｉｔｉｅｓＬａｎｄｓｃａｐｅＣｏ．Ｌｔｄ，Ｈａｎｇｚｈｏｕ　３１００１２，Ｚｈｅｊｉａｎｇ，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：［Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ］Ｔｏｒｅｖｅａｌｔｈｅｅｆｆｅｃｔｏｆａｖｏｉｄｉｎｇｌｉｇｈｔｔｒｅａｔｍｅｎｔｏｎｔｈｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｏｆｇｅｎｅｓｒｅｌａｔｅｄｔｏｔｈｅｓｙｎ ｔｈｅｓｉｓｏｆｂｉｔｔｅｒａｎｄａｓｔｒｉｎｇｅｎｔｓｕｂｓｔａｎｃｅｓｉｎＤｅｎｄｒｏｃａｌａｍｕｓｌａｔｉｆｌｏｒｕｓｓｈｏｏｔ．［Ｍｅｔｈｏｄ］Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｗａｓｃａｒｒｉｅｄｏｕｔｏｎｂａｍｂｏｏｓｈｏｏｔｓｗｉｔｈｎａｔｕｒａｌｇｒｏｗｔｈ（ＣＫ）ａｎｄｓｏｉｌｃｏｖｅｒｅｄｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ（ＥＰ）ｂｙｕｓｉｎｇＩｌｌｕｍｉｎａ ＴＭ ＨｉＳｅｑ ２５００ｐｌａｔｆｏｒｍ，ａｎｄｔｈｅｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｇｅｎｅｓｗｅｒｅａｎａｌ